RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496840.1

TARDBP-210, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene TARDBP, Length 692 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-210ENST00000496840 MAGEH1Q9H213 219 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 ARL15Q9NXU5 204 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 PLK2Q9NYY3 685 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 SELENONQ9NZV5 590 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 ACKR2O00590 384 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 NGFRP08138 427 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 PRPH2P23942 346 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 ZXDBP98169 803 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 GALNTL6Q49A17 601 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 LIN54Q6MZP7 749 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 WASF1Q92558 559 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 PIGSQ96S52 555 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 CRB3Q9BUF7 120 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 WWOXQ9NZC7 414 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 GRM8O00222 908 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 HLA-DQA2P01906 255 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 SERPINA4P29622 427 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 CDK18Q07002 472 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 FOXO1Q12778 655 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 DCTN1Q14203 1278 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 RPS6KA2Q15349 733 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 CCDC25Q86WR0 208 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 BICD2Q8TD16 824 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 DACT1Q9NYF0 836 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 PKMP14618 531 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 ARSBP15848 533 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 MLH1P40692 756 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 UBE4AQ14139 1066 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 Q9N2J8 555 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 BAG5Q9UL15 447 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 SLC28A2O43868 658 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 TNFSF8P32971 234 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 EGR4Q05215 589 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 DPP10Q8N608 796 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 C3orf49Q96BT1 292 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 SLC39A13Q96H72 371 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 LRFN1Q9P244 771 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 WNT16Q9UBV4 365 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 TMEM247A6NEH6 219 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 CYP21A2P08686 494 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 HOXC6P09630 235 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 KLRC2P26717 231 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 CYP2J2P51589 502 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 SELENOVP59797 346 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 BLMHQ13867 455 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 C5orf22Q49AR2 442 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 MTFR2Q6P444 385 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 ARRDC3Q96B67 414 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 FRG2BQ96QU4 278 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 MEIS3Q99687 375 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 HIPK3Q9H422 1215 aa6.47□□□□□ -1.37
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