RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PKMP14618 531 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOXB2P14652 356 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHN1P15882 459 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRKAA2P54646 552 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAD2Q05329 585 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PMPCAQ10713 525 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BIRC2Q13490 618 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTGR1Q14914 329 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRTGQ2VWP7 1150 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLK5Q496M5 336 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ENTPD8Q5MY95 495 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HMBOX1Q6NT76 420 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RASGRP2Q7LDG7 609 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INPP5DQ92835 1189 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EBF3Q9H4W6 596 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 G6PC2Q9NQR9 355 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM248Q9NWD8 314 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARL15Q9NXU5 204 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANAPC4Q9UJX5 808 aa5□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 E7EVH7 732 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MDM4O15151 490 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCP2P22307 547 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AVPR2P30518 371 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAPPC10P48553 1259 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TIGD6Q17RP2 521 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SYT13Q7L8C5 426 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM199Q8N511 208 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYCT1Q8N699 235 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TWSG1Q9GZX9 223 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q9N2J8 555 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMLHEQ9NVH6 421 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BAG5Q9UL15 447 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COMMD10Q9Y6G5 202 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACP5P13686 325 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHRNA5P30532 468 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCKARP32238 428 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC16A2P36021 539 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 P2RX3P56373 397 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDCLQ13371 301 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CUL4BQ13620 913 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PKP1Q13835 747 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POSTNQ15063 836 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF144BQ7Z419 303 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCN4BQ8IWT1 228 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNJ9Q92806 393 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARPC5LQ9BPX5 153 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TASP1Q9H6P5 420 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTPRHQ9HD43 1115 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLQ9UEF7 1012 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TFRCP02786 760 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALPLP05186 524 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNHG28P0DPA3 235 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TYK2P29597 1187 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADD2P35612 726 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OAZ1P54368 228 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VPS52Q8N1B4 723 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GALNT15Q8N3T1 639 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC25A41Q8N5S1 370 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KDM1BQ8NB78 822 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAMTS15Q8TE58 950 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SDCCAG3Q96C92 435 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM31Q9BZY9 425 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLPBQ9H078 707 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLEKHA2Q9HB19 425 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SAYSD1Q9NPB0 183 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF146Q9NTX7 359 aa4.97□□□□□ -1.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa4.96□□□□□ -1.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C17orf100A8MU93 164 aa4.96□□□□□ -1.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPTLC2O15270 562 aa4.96□□□□□ -1.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT38O76015 456 aa4.96□□□□□ -1.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLKB1P03952 638 aa4.96□□□□□ -1.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARSAP15289 507 aa4.96□□□□□ -1.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPATQ06203 517 aa4.96□□□□□ -1.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALG10Q5BKT4 473 aa4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms