RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494945.1

PKP4-215, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 5

Gene PKP4, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-215	ENST00000494945	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	SGSH	P51688	502 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	WASHC5	Q12768	1159 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF77	Q15935	545 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	ANO4	Q32M45	955 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	MPPE1	Q53F39	396 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	MPP7	Q5T2T1	576 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	CES5A	Q6NT32	575 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	HOOK3	Q86VS8	718 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	OTUB2	Q96DC9	234 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	GDE1	Q9NZC3	331 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	CCL26	Q9Y258	94 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	COL4A3	Q01955	1670 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	ILVBL	A1L0T0	632 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	MATN3	O15232	486 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	CHAD	O15335	359 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	TP73	O15350	636 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	TSPAN3	O60637	253 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	TBL1X	O60907	577 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	CYBB	P04839	570 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	RHOC	P08134	193 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	PTPN3	P26045	913 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	GNA12	Q03113	381 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	IL10RB	Q08334	325 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	SERINC3	Q13530	473 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	TEX44	Q53QW1	395 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF567	Q8N184	647 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	MAML1	Q92585	1016 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	HMCES	Q96FZ2	354 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	IL12RB2	Q99665	862 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	SP110	Q9HB58	689 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	OBP2A	Q9NY56	170 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945	REV3L	O60673	3130 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PKP4-215	ENST00000494945		H0Y626	953 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	KCNK1	O00180	336 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	FAM153B	P0C7A2	387 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	CCNB1	P14635	433 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	TPSB2	P20231	275 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	MTHFR	P42898	656 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	MAGEA6	P43360	314 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	RENBP	P51606	427 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	NRL	P54845	237 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	OXCT1	P55809	520 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	SEMA5A	Q13591	1074 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	GRIN2C	Q14957	1233 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	COL19A1	Q14993	1142 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	TPSAB1	Q15661	275 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	PARP6	Q2NL67	630 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	FAM153C	Q494X1	144 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	RNF43	Q68DV7	783 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-215	ENST00000494945	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61

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