RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TCP10LQ8TDR4 215 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CYTH2Q99418 400 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 KLC2Q9H0B6 622 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.263e-6■□□□□ 9.1
HERC4-211ENST00000492996 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PHTF1Q9UMS5 762 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 E7ESA3 106 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DPYSL4O14531 572 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 UGT1A9O60656 530 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ABLIM3O94929 683 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 RPL9P32969 192 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SNX16P57768 344 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MGAT5Q09328 741 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SYPL2Q5VXT5 272 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 Q7L0L9 218 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MPP5Q8N3R9 675 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DCAKDQ8WVC6 231 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CSPG4P5Q96PW8 444 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 UGT1A7Q9HAW7 530 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 UGT1A10Q9HAW8 530 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 UGT1A8Q9HAW9 530 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NUP205Q92621 2012 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 M0QYT0 321 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NDC80O14777 642 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SYN3O14994 580 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MDM4O15151 490 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MGEA5O60502 916 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 OAS1P00973 400 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TGM2P21980 687 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 BMPR2Q13873 1038 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SV2CQ496J9 727 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CLLU1OSQ5K130 101 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CASC4Q6P4E1 433 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SYCE2Q6PIF2 218 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 HASPINQ8TF76 798 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TEKT4Q8WW24 435 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SERAC1Q96JX3 654 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TNIP3Q96KP6 325 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 RIPOR3Q96MK2 946 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 KCNK16Q96T55 309 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PAAF1Q9BRP4 392 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ZNF670Q9BS34 389 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TEX264Q9Y6I9 313 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GVG6 124 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CAPN9O14815 690 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TYROBPO43914 113 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ANP32DO95626 131 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 FESP07332 822 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TYMPP19971 482 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ARL4AP40617 200 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 KCNJ2P63252 427 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 AP1B1Q10567 949 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SNX30Q5VWJ9 437 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 VPS52Q8N1B4 723 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SCML4Q8N228 414 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PRSS33Q8NF86 280 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 STK32AQ8WU08 396 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TTC17Q96AE7 1141 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SENP8Q96LD8 212 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PGLYRP2Q96PD5 576 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ECT2Q9H8V3 914 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 KRT82Q9NSB4 513 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MARCH5Q9NX47 278 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms