RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 RETREG1Q9H6L5 497 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ADAM22Q9P0K1 906 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 FERP16591 822 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 STK19P49842 368 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 IRAK1P51617 712 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF783Q6ZMS7 281 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 STRADAQ7RTN6 431 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 FRS2Q8WU20 508 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 RXFP2Q8WXD0 754 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDHB18PQ96TA0 734 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 C11orf70Q9BRQ4 267 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 FSCN3Q9NQT6 498 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 LRRC72A6NJI9 287 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 C2CD4BA6NLJ0 364 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 E9PAM4 449 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 MID1O15344 667 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 CNTN5O94779 1100 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 RHOCP08134 193 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 KRT3P12035 628 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 GOT1P17174 413 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 CD27P26842 260 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 GGCXP38435 758 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPN9P43378 593 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF165P49910 485 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 PTP4A2Q12974 167 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 GRIK2Q13002 908 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ALFQ53S48 1182 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM46CQ5VWP2 391 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 PIP4P1Q86T03 277 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM131BQ86XD5 332 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 STK40Q8N2I9 435 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 OR52K2Q8NGK3 314 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 BIRC7Q96CA5 298 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 AGPAT1Q99943 283 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 HS3ST2Q9Y278 367 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ALOX15BO15296 676 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 PMLP29590 882 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 SHC2P98077 582 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP11AP98196 1134 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 TEAD4Q15561 434 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC14Q49A88 953 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ACCSLQ4AC99 568 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 KIAA0895LQ68EN5 471 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 EMC1Q8N766 993 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 C3orf20Q8ND61 904 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 OR2T34Q8NGX1 318 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 OR8D1Q8WZ84 308 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 SNX19Q92543 992 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 NEUROG2Q9H2A3 272 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ACACBO00763 2458 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 A0A1W2PP55 124 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ILVBLA1L0T0 632 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 MCF2LO15068 1137 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 FSBPO95073 299 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 IL1BP01584 269 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF883P0CG24 379 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 OR1E1P30953 314 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ADRA1BP35368 520 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 CLCN6P51797 869 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 GALCP54803 685 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 DLG2Q15700 870 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 SH2D3CQ8N5H7 860 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 DCAF4L2Q8NA75 395 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ZYG11BQ9C0D3 744 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 OSBPL2Q9H1P3 480 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDH15Q96QU1 1955 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 PCNX2A6NKB5 2137 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 NUMA1Q14980 2115 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM170AA1A519 330 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 SIGLEC16A6NMB1 481 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC7A4O43246 635 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 SRGAP2O75044 1071 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 GJB3O75712 270 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 CER1O95813 267 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 PSMD8P48556 350 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC20A2Q08357 652 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 DEFB124Q8NES8 71 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC114Q96M63 670 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 KDM4CQ9H3R0 1056 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 MPP6Q9NZW5 540 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 OR12D3Q9UGF7 316 aa24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms