RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 GRM6O15303 877 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 DRC3Q9H069 523 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ZFP14Q9HCL3 533 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 FZD10Q9ULW2 581 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 PRR23AA6NEV1 266 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 RHOBTB1O94844 696 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GFAPP14136 432 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 PSMB4P28070 264 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 RPL22P35268 128 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SYPL2Q5VXT5 272 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 USP45Q70EL2 814 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 PLD5Q8N7P1 536 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CXorf38Q8TB03 319 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ING5Q8WYH8 240 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ZIM3Q96PE6 472 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGEF4Q9NR80 690 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SLC39A10Q9ULF5 831 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GJB5O95377 273 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 PGAM1P18669 254 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 NFKB1P19838 968 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CNTFP26441 200 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CTGFP29279 349 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ELK3P41970 407 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GABRB2P47870 512 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CYP4F8P98187 520 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC26Q2I0M4 334 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CAVIN3Q969G5 261 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SH3KBP1Q96B97 665 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MTBPQ96DY7 904 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SEMA3CQ99985 751 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 IL22Q9GZX6 179 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CLPBQ9H078 707 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MAGEH1Q9H213 219 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 HACD3Q9P035 362 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 FIS1Q9Y3D6 152 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 NRIP1P48552 1158 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MAP7Q14244 749 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 DSC3Q14574 896 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 KIRREL3Q8IZU9 778 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 OR2W6PQ8NHA6 318 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 P2RY11Q96G91 374 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SGSM3Q96HU1 749 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CEP295NLQ96MC4 621 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GRID1Q9ULK0 1009 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GOLGA8RI6L899 631 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MAP3K7O43318 606 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SPAG7O75391 227 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 VPS26AO75436 327 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SRP72O76094 671 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 PCDH8O95206 1070 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CD86P42081 329 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB6Q15916 424 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 DPYSL2Q16555 572 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MROH9Q5TGP6 573 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 RFWD3Q6PCD5 774 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SLC26A11Q86WA9 606 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 OR10T2Q8NGX3 314 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 KCNN1Q92952 543 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM55Q9BYV6 548 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CLDND1Q9NY35 253 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 PLK2Q9NYY3 685 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SLC24A2Q9UI40 661 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 TPH1P17752 444 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 FSHRP23945 695 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MGAT1P26572 445 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 HADHAP40939 763 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 NDST2P52849 883 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MGAT3Q09327 533 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MPP3Q13368 585 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SPANXN3Q5MJ09 141 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 RTP2Q5QGT7 225 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CASD1Q96PB1 797 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 TM6SF2Q9BZW4 377 aa8.43□□□□□ -1.06
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