RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC25Q86WR0 208 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM71BQ8TC56 605 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP2A3Q93084 1043 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 SPAG4Q9NPE6 437 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 OBP2BQ9NPH6 170 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 CNTN6Q9UQ52 1028 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 WDR62O43379 1518 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 TONSLQ96HA7 1378 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 AGAP5A6NIR3 686 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC38A8A6NNN8 435 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 IFNA2P01563 188 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 LCKP06239 509 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 PTMAP06454 111 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 ITGA2BP08514 1039 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 ENTPD1P49961 510 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 CBX1P83916 185 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 RPS6KA2Q15349 733 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 GPR162Q16538 588 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 MAP9Q49MG5 647 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 ENTPD8Q5MY95 495 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 KDELC2Q7Z4H8 507 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 CNPY4Q8N129 248 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 RTKNQ9BST9 563 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 ISCUQ9H1K1 167 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 HIF1ANQ9NWT6 349 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 ARL15Q9NXU5 204 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 TBC1D14Q9P2M4 693 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC25A13Q9UJS0 675 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 MROH2BQ7Z745 1585 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 LGALS16A8MUM7 142 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 EFCAB8A8MWE9 144 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 NEURL1O76050 574 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 TGFB3P10600 412 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 GYS1P13807 737 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 CPA1P15085 419 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 PTMSP20962 102 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 PCP4P48539 62 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 RCAN1P53805 252 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 ADPRHP54922 357 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC20A2Q08357 652 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF585BQ52M93 769 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 WASHC2DQ5SRD0 308 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 PARM1Q6UWI2 310 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 Q6ZTK2 550 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 TMTC2Q8N394 836 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC25A41Q8N5S1 370 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 C7orf57Q8NEG2 295 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 OIT3Q8WWZ8 545 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 RSC1A1Q92681 617 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 INPP5DQ92835 1189 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 MYLK2Q9H1R3 596 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 ERICH3Q5RHP9 1530 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A087WV62 115 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 KLKB1P03952 638 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 CYP1A2P05177 515 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 NGFRP08138 427 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 SETSIPP0DME0 302 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 KLRC2P26717 231 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 ARRB2P32121 409 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 MLH1P40692 756 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 TNFAIP2Q03169 654 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 PFKFB4Q16877 469 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 TBRG1Q3YBR2 411 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 NFRKBQ6P4R8 1299 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 PDXDC1Q6P996 788 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC30A9Q6PML9 568 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 KLHL17Q6TDP4 642 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 RTL10Q7L3V2 364 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 RAB11FIP2Q7L804 512 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM200AQ86VY9 491 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 GPSM1Q86YR5 675 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 CAMK1DQ8IU85 385 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 DPP10Q8N608 796 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms