RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.6□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 E2F8A0AVK6 867 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RNF103O00237 685 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CNTFP26441 200 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 ZBTB17Q13105 803 aa6.6□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.6□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 MSS51Q4VC12 460 aa6.6□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 SLC29A2Q14542 456 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ADGRF1Q5T601 910 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CNTD1Q8N815 330 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 STON2Q8WXE9 905 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 IGSF8Q969P0 613 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TRIB3Q96RU7 358 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RNF40O75150 1001 aa6.59□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 ATP5DP30049 168 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 STX2P32856 288 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ERVFC1P60507 584 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GAREM2Q75VX8 874 aa6.59□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 A0A1B0GVM2 712 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 H7C0C1 242 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CDH16O75309 829 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SHBGP04278 402 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PGAM1P18669 254 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PHBP35232 272 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PBX3P40426 434 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ATP5OP48047 213 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SLC11A2P49281 568 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF77Q15935 545 aa6.59□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 LRRC31Q6UY01 552 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RANBP10Q6VN20 620 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 LCA5Q86VQ0 697 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RNF38Q9H0F5 515 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GLOD4Q9HC38 313 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GGA2Q9UJY4 613 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SOX13Q9UN79 622 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 LCHNA4D1U4 455 aa6.58□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.58□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 ANXA9O76027 345 aa6.58□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 MYZAPP0CAP1 466 aa6.58□□□□□ -1.36
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