RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 VPS45Q9NRW7 570 aa20.43■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.43■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.43■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 SPTBN4Q9H254 2564 aa20.43■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 CEP250Q9BV73 2442 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 A0A087X0T9 212 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 FAM72CH0Y354 149 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 NDUFS2O75306 463 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 LRIG2O94898 1065 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 IGLV3-19P01714 112 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 TPM1P09493 284 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF806P0C7X5 589 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 FAM228BP0C875 321 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 OXTRP30559 389 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 PTGER3P43115 390 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 VASPP50552 380 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 AIF1P55008 147 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 RPS14P62263 151 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 KRT83P78385 493 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 ZBTB16Q05516 673 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 PRR23CQ6ZRP0 262 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 FAM72BQ86X60 149 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 DRC7Q8IY82 874 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 DEFB119Q8N690 84 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 FNIP1Q8TF40 1166 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 MAGEB5Q9BZ81 275 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 CEP192Q8TEP8 1941 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 DCHS1Q96JQ0 3298 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 A0A0D9SEW6 157 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 ILVBLA1L0T0 632 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 DNTTP04053 509 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 RHOQP17081 205 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 L1CAMP32004 1257 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 LYSMD4Q5XG99 296 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 PIGKQ92643 395 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 PSMB7Q99436 277 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 DNAJC7Q99615 494 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM7Q9C029 511 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 FZD10Q9ULW2 581 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 ATP9BO43861 1147 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 SNAP91O60641 907 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGAP8P85298 464 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF33AQ06730 810 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 ACCSLQ4AC99 568 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 SARM1Q6SZW1 724 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 NLRP14Q86W24 1093 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 OR7D4Q8NG98 312 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 FRS2Q8WU20 508 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 PTPRN2Q92932 1015 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 SMOC1Q9H4F8 434 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 VPS51Q9UID3 782 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 SCML1Q9UN30 329 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 NEU3Q9UQ49 428 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS1-206ENST00000470271 RNF8O76064 485 aa20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 DPP6P42658 865 aa20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 MAPKAPK2P49137 400 aa20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 GNA12Q03113 381 aa20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 DLG2Q15700 870 aa20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 FAM124AQ86V42 546 aa20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 EPAS1Q99814 870 aa20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SPON2Q9BUD6 331 aa20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 GPR174Q9BXC1 333 aa20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 THAP2Q9H0W7 228 aa20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 VAV1P15498 845 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ITPKAP23677 461 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 EPHB2P29323 1055 aa20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms