RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 EID2BQ96D98 161 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 LYZL4Q96KX0 146 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 PRDM8Q9NQV8 689 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 DTX4Q9Y2E6 619 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 PKP3Q9Y446 797 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 LRP12Q9Y561 859 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.693e-12■■■□□ 15.5
RABGGTB-206ENST00000467748 PTPRMP28827 1452 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 SYT5O00445 386 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 MDM4O15151 490 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 IFNA2P01563 188 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 KLRC2P26717 231 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 HTR3AP46098 478 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 POLE2P56282 527 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 TMPRSS3P57727 454 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 AP2B1P63010 937 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 PDCLQ13371 301 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 SEMA3AQ14563 771 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 RPS6KA2Q15349 733 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 TTC22Q5TAA0 569 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 NFRKBQ6P4R8 1299 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 LVRNQ6Q4G3 990 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 KLHL17Q6TDP4 642 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 KLBQ86Z14 1044 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 VPS52Q8N1B4 723 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 POF1BQ8WVV4 589 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 WASF1Q92558 559 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 RSC1A1Q92681 617 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 C3orf49Q96BT1 292 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF479Q96JC4 524 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF700Q9H0M5 742 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 ISCUQ9H1K1 167 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 MYLK2Q9H1R3 596 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 PDE11AQ9HCR9 933 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 TBC1D14Q9P2M4 693 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 IQSEC2Q5JU85 1478 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 BECN2A8MW95 431 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 F5H423 210 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 CDK18Q07002 472 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 TRAF1Q13077 416 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 ERV3-1Q14264 604 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 ALG10Q5BKT4 473 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 ALG10BQ5I7T1 473 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 MTFR2Q6P444 385 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC25A41Q8N5S1 370 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 C7orf57Q8NEG2 295 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 STT3BQ8TCJ2 826 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNJ9Q92806 393 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 RMDN3Q96TC7 470 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 Q9N2J8 555 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 DACT1Q9NYF0 836 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 GRHPRQ9UBQ7 328 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 TAGLN3Q9UI15 199 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 KCND3Q9UK17 655 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 EVPLQ92817 2033 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 MAPKBP1O60336 1514 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 NPIPB13A6NJU9 1138 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 NPIPB4C9JG80 1138 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 TYK2P29597 1187 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 SERPINA4P29622 427 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 CHRNA5P30532 468 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 TNFSF8P32971 234 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 ICA1Q05084 483 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 UBE4AQ14139 1066 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 TUBB8Q3ZCM7 444 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF585BQ52M93 769 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 ERAP2Q6P179 960 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 PARM1Q6UWI2 310 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 Q6ZTK2 550 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 RAB11FIP2Q7L804 512 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 LRRC57Q8N9N7 239 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 ENGASEQ8NFI3 743 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC2A12Q8TD20 617 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms