RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465393.1

TNIK-208, Transcript of TRAF2 and NCK interacting kinase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIK, Length 750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIK-208ENST00000465393 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.64■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 CADM4Q8NFZ8 388 aa20.64■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 IQCDQ96DY2 449 aa20.64■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 MCEEQ96PE7 176 aa20.64■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 EDEM2Q9BV94 578 aa20.64■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.64■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 SCML1Q9UN30 329 aa20.64■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 LNP1A1A4G5 178 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 GZMAP12544 262 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 RRM1P23921 792 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 HDAC4P56524 1084 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 DUOXA1Q1HG43 343 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 TRIM61Q5EBN2 209 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 STPG1Q5TH74 334 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 FAM124AQ86V42 546 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 CEP76Q8TAP6 659 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 NTAN1Q96AB6 310 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 PCED1AQ9H1Q7 454 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 IFNKQ9P0W0 207 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 OR12D3Q9UGF7 316 aa20.63■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 MEI4A8MW99 385 aa20.62■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 CCP110O43303 1012 aa20.62■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 DESP17661 470 aa20.62■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 OR1E1P30953 314 aa20.62■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 KRT83P78385 493 aa20.62■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 IRX4P78413 519 aa20.62■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 ARTNQ5T4W7 220 aa20.62■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 IL31Q6EBC2 164 aa20.62■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 SLC23A3Q6PIS1 610 aa20.62■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.62■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 PTPRN2Q92932 1015 aa20.62■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 CNPY3Q9BT09 278 aa20.62■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 SUSD2Q9UGT4 822 aa20.62■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 ATP9BO43861 1147 aa20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 CFIP05156 583 aa20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 TPM3P06753 285 aa20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 SCAPQ12770 1279 aa20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 CST6Q15828 149 aa20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 MANEALQ5VSG8 457 aa20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 USP30Q70CQ3 517 aa20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 CCDC185Q8N715 623 aa20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 PARVAQ9NVD7 372 aa20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.61■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 ILVBLA1L0T0 632 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 METTL12A8MUP2 240 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 SKILP12757 684 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 ACSL1P33121 698 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 ZBED6P86452 979 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 FOXK2Q01167 660 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 ACCSLQ4AC99 568 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 SLFN11Q7Z7L1 901 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 STK40Q8N2I9 435 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 GANCQ8TET4 914 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 FRS2Q8WU20 508 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 DNASE2BQ8WZ79 361 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 PSMB7Q99436 277 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 TSPY26PQ9H489 355 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 SGK2Q9HBY8 427 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 TMEM9BQ9NQ34 198 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 VPS51Q9UID3 782 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 SLC6A14Q9UN76 642 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 NCOR2Q9Y618 2525 aa20.6■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa20.59■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 KNL1Q8NG31 2342 aa20.59■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 A0A0D9SEW6 157 aa20.59■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 DCDC2BA2VCK2 349 aa20.59■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 MID1O15344 667 aa20.59■□□□□ 0.89
TNIK-208ENST00000465393 SNAP91O60641 907 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms