RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 UBASH3AP57075 661 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 USP30Q70CQ3 517 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 MCOLN2Q8IZK6 566 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 OR52K2Q8NGK3 314 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 FAM172AQ8WUF8 416 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 DNASE2BQ8WZ79 361 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 PTPRN2Q92932 1015 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 SYT11Q9BT88 431 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 ZYG11BQ9C0D3 744 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 HAUS4Q9H6D7 363 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM9BQ9NQ34 198 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 CEP192Q8TEP8 1941 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 C4orf47A7E2U8 309 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 OR1E1P30953 314 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 DCAF12L1Q5VU92 463 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 TTYH3Q9C0H2 523 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 OSBPL2Q9H1P3 480 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 RETREG1Q9H6L5 497 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 SGK2Q9HBY8 427 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 MPP6Q9NZW5 540 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 OR12D3Q9UGF7 316 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 DNAH14Q0VDD8 3507 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 TM4SF5O14894 197 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 DESP17661 470 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 ACSL1P33121 698 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 PRKCIP41743 596 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 NUMBP49757 651 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 CST6Q15828 149 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 ACCSLQ4AC99 568 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 DCUN1D2Q6PH85 259 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF783Q6ZMS7 281 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 GANCQ8TET4 914 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 FAM129BQ96TA1 746 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 CACNA1AO00555 2505 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 ILVBLA1L0T0 632 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 ATP9BO43861 1147 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 GZMAP12544 262 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 ENGP17813 658 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 RRM1P23921 792 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 MAOBP27338 520 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 HDAC4P56524 1084 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 RAB6CQ53S08 254 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 STK40Q8N2I9 435 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 FRS2Q8WU20 508 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 NTAN1Q96AB6 310 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 IQCDQ96DY2 449 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 MCEEQ96PE7 176 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 RAB6CQ9H0N0 254 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 CAPN10Q9HC96 672 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 FBXL12Q9NXK8 326 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 A0A1W2PQJ5 194 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 SEMA4FO95754 770 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 ADH1BP00325 375 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 SYPP08247 313 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 SLC8A1P32418 973 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 DLG2Q15700 870 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 DSG4Q86SJ6 1040 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 SH2D3CQ8N5H7 860 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 OMDQ99983 421 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 CNPY3Q9BT09 278 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 PARVAQ9NVD7 372 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 TAS2R14Q9NYV8 317 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 HS3ST2Q9Y278 367 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPN4-208ENST00000460289 LAMA1P25391 3075 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 A0A1B0GTW7 788 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 ARHGAP33O14559 1287 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 MID1O15344 667 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 C5AR1P21730 350 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 PBX1P40424 430 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 ARTNQ5T4W7 220 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 SLFN11Q7Z7L1 901 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 DCAF4L2Q8NA75 395 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 ATP11CQ8NB49 1132 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 OR8D1Q8WZ84 308 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 PSMB7Q99436 277 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 FZD4Q9ULV1 537 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPN4-208ENST00000460289 A0A0D9SEW6 157 aa23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms