RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 OVGP1Q12889 678 aa27.17■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 FAM46CQ5VWP2 391 aa27.17■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 ISM2Q6H9L7 571 aa27.17■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 FBXL19Q6PCT2 694 aa27.17■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 TRIM59Q8IWR1 403 aa27.17■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 PPP1R9BQ96SB3 815 aa27.17■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 NRSN2Q9GZP1 204 aa27.17■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa27.17■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 CYTH4Q9UIA0 394 aa27.17■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 MAN1B1Q9UKM7 699 aa27.17■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 BICDL2A1A5D9 508 aa27.16■■□□□ 1.94
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PBRM1-218ENST00000458294 BNIP3Q12983 259 aa27.16■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP27.16■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 HES3Q5TGS1 186 aa27.16■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 KLHL10Q6JEL2 608 aa27.16■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF606Q8WXB4 792 aa27.16■■□□□ 1.94
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PBRM1-218ENST00000458294 CRELD1Q96HD1 420 aa27.16■■□□□ 1.94
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PBRM1-218ENST00000458294 GNA14O95837 355 aa27.15■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 AFPP02771 609 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 MARSP56192 900 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 RTP5Q14D33 572 aa27.15■■□□□ 1.94
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PBRM1-218ENST00000458294 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
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PBRM1-218ENST00000458294 FAM204AQ9H8W3 233 aa27.15■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 SLC25A13Q9UJS0 675 aa27.15■■□□□ 1.94
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PBRM1-218ENST00000458294 GNA15P30679 374 aa27.14■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 CCR1P32246 355 aa27.14■■□□□ 1.94
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PBRM1-218ENST00000458294 METAP1P53582 386 aa27.14■■□□□ 1.94
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PBRM1-218ENST00000458294 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa27.14■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 AK5Q9Y6K8 562 aa27.14■■□□□ 1.94
PBRM1-218ENST00000458294 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa27.13■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 THAP12O43422 761 aa27.13■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 ATP9BO43861 1147 aa27.13■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 RTN2O75298 545 aa27.13■■□□□ 1.93
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PBRM1-218ENST00000458294 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa27.13■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa27.13■■□□□ 1.93
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PBRM1-218ENST00000458294 SARDHQ9UL12 918 aa27.13■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 MYLKQ15746 1914 aa27.12■■□□□ 1.93
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PBRM1-218ENST00000458294 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 SEMG2Q02383 582 aa27.12■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 TAF5Q15542 800 aa27.12■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 ACCSLQ4AC99 568 aa27.12■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 AGBL4Q5VU57 503 aa27.12■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 RNF34Q969K3 372 aa27.12■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 ALG14Q96F25 216 aa27.12■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 SLC2A13Q96QE2 648 aa27.12■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 ASNSD1Q9NWL6 643 aa27.12■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 PPM1HQ9ULR3 514 aa27.12■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 CTNND2Q9UQB3 1225 aa27.12■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa27.11■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 MCF2LO15068 1137 aa27.11■■□□□ 1.93
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PBRM1-218ENST00000458294 DEFB106AQ8N104 65 aa27.11■■□□□ 1.93
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PBRM1-218ENST00000458294 ITPKBP27987 946 aa27.1■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 CENPCQ03188 943 aa27.1■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 DLG2Q15700 870 aa27.1■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 PROX2Q3B8N5 592 aa27.1■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 EFHC1Q5JVL4 640 aa27.1■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 BAP1Q92560 729 aa27.1■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 ACP6Q9NPH0 428 aa27.1■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa27.09■■□□□ 1.93
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