RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449844.6

NPAS1-202, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPAS1, Length 2,043 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-202ENST00000449844 CEP57Q86XR8 500 aa22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 NUDCD3Q8IVD9 361 aa22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 RNF34Q969K3 372 aa22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 TUBB6Q9BUF5 446 aa22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 KCNK13Q9HB14 408 aa22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 BFARQ9NZS9 450 aa22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 BPGMP07738 259 aa22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 SLC11A1P49279 550 aa22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 RASSF3Q86WH2 238 aa22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 OR52K1Q8NGK4 314 aa22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 HAO1Q9UJM8 370 aa22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 CD68P34810 354 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 HTR7P34969 479 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 SLC5A3P53794 718 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 TMPRSS15P98073 1019 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 CDK18Q07002 472 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 BRMS1LQ5PSV4 323 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 CERS2Q96G23 380 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 TOX2Q96NM4 488 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 MARCH5Q9NX47 278 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 ZFATQ9P243 1243 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 HCSTQ9UBK5 93 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 HEY2Q9UBP5 337 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 VANGL2Q9ULK5 521 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa22.25■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 GLRA3O75311 464 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 GP5P40197 560 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 BST1Q10588 318 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 ZNF280DQ6N043 979 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 ATP2A3Q93084 1043 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 CPNE1Q99829 537 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 MECRQ9BV79 373 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 IRAK2O43187 625 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 NPY2RP49146 381 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 OCRLQ01968 901 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 ZBTB17Q13105 803 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 CHI3L2Q15782 390 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 GRTP1Q5TC63 336 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 SKA1Q96BD8 255 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
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NPAS1-202ENST00000449844 AGAP3Q96P47 875 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 TSGA13Q96PP4 275 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 HAPLN3Q96S86 360 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 WBP1LQ9NX94 342 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 TXNDC16Q9P2K2 825 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 STK38LQ9Y2H1 464 aa22.24■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 MAGEB16A2A368 324 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 AP3B1O00203 1094 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 PSMD3O43242 534 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 USP1O94782 785 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 HAUS5O94927 633 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 ITGA2BP08514 1039 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 FUT10Q6P4F1 479 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 TMEM135Q86UB9 458 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 DPF3Q92784 378 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 KCNK4Q9NYG8 393 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 TPP1O14773 563 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 NFKB1P19838 968 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 PRPSAP1Q14558 356 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 INSCQ1MX18 579 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 LRRC43Q8N309 656 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 SLC17A6Q9P2U8 582 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 PSAT1Q9Y617 370 aa22.23■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 OR6C75A6NL08 312 aa22.22■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 TNFRSF10BO14763 440 aa22.22■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 SNNO75324 88 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 CBX6O95503 412 aa22.22■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 DNAJB2P25686 324 aa22.22■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NPAS1-202ENST00000449844 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.22■■□□□ 1.15
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