RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 CEP70Q8NHQ1 597 aa15.24■□□□□ 0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 PGBD4Q96DM1 585 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 HAUS8Q9BT25 410 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 RNF181Q9P0P0 153 aa15.24■□□□□ 0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 TRPA1O75762 1119 aa15.23■□□□□ 0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 PKNOX1P55347 436 aa15.23■□□□□ 0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa15.23■□□□□ 0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 C22orf31O95567 290 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ATICP31939 592 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 PHKA2P46019 1235 aa15.23■□□□□ 0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 HESX1Q9UBX0 185 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 POLBP06746 335 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF23P17027 643 aa15.22■□□□□ 0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 PPP2R5DQ14738 602 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 HERC3Q15034 1050 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 WDR41Q9HAD4 459 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 NR2E3Q9Y5X4 410 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 HACD1B0YJ81 288 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 NEMP1O14524 444 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 HDAC3O15379 428 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 DGKIO75912 1065 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 NDST1P52848 882 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 COG7P83436 770 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 SLC6A3Q01959 620 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TMED1Q13445 227 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 LPIN1Q14693 890 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 SPANXN3Q5MJ09 141 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ARMCX2Q7L311 632 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TSPAN14Q8NG11 270 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 CXorf38Q8TB03 319 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 CDCA5Q96FF9 252 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 SLC4A5Q9BY07 1137 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF385DQ9H6B1 395 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 H0YJX3 145 aa15.22■□□□□ 0.03
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