RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428457.1

TNS3-204, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS3, Length 5,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-204ENST00000428457 MED26O95402 600 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 PIGNO95427 931 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 LGALS2P05162 132 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 UQCRBP14927 111 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 JAK1P23458 1154 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 GP5P40197 560 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 MYL6P60660 151 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CDH24Q86UP0 819 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TMEM86AQ8N2M4 240 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 PARP8Q8N3A8 854 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 SNX31Q8N9S9 440 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 BDH2Q9BUT1 245 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 GPAMQ9HCL2 828 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 RNF112Q9ULX5 631 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 COX4I1P13073 169 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ADCYAP1R1P41586 468 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 FLT3LGP49771 235 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 SCNN1BP51168 640 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CCR3P51677 355 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 DRG2P55039 364 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 PDK2Q15119 407 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 LY6KQ17RY6 165 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 PPP4R4Q6NUP7 873 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TRABD2AQ86V40 505 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 LRRC39Q96DD0 335 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ABHD8Q96I13 439 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 IGFLR1Q9H665 355 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 AP4E1Q9UPM8 1137 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 NFASCO94856 1347 aa10.17□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TPP1O14773 563 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TLL1O43897 1013 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ASS1P00966 412 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 GRIA3P42263 894 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 DLG4P78352 724 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 NFIL3Q16649 462 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 FBXO47Q5MNV8 452 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ACOT1Q86TX2 421 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 KLRG1Q96E93 195 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 C9orf16Q9BUW7 83 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 IL17RBQ9NRM6 502 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 SH3GLB1Q9Y371 365 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 SOAT2O75908 522 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 IMPDH2P12268 514 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 SOAT1P35610 550 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CCT8P50990 548 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 RENBPP51606 427 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TTC27Q6P3X3 843 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ZPBP2Q6X784 338 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ATG14Q6ZNE5 492 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ZNF398Q8TD17 642 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 EPS8L1Q8TE68 723 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ZNF606Q8WXB4 792 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TRIM63Q969Q1 353 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CCDC126Q96EE4 140 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 MCRS1Q96EZ8 462 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CNPY3Q9BT09 278 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 NMUR2Q9GZQ4 415 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TMCO1Q9UM00 188 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 PLA2G6O60733 806 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CBFA2T3O75081 653 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TNFRSF21O75509 655 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CYP2F1P24903 491 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 IL12RB1P42701 662 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 PPP3CCP48454 512 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TWF1Q12792 350 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 LPIN1Q14693 890 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 FAM171A1Q5VUB5 890 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 LINC00523Q86TU6 105 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 BBS7Q8IWZ6 715 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 GPR63Q9BZJ6 419 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 VANGL2Q9ULK5 521 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 NDUFAF1Q9Y375 327 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ANXA9O76027 345 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 LAG3P18627 525 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 DNAJB2P25686 324 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 LRPAP1P30533 357 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 NAA20P61599 178 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CRADDP78560 199 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TRAF3Q13114 568 aa10.16□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms