RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 OR51B4Q9Y5P0 310 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 PTPRBP23467 1997 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 FAM47DPA6NHR8 397 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 H0Y8X5 98 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 M0QYT0 321 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 ALOX15BO15296 676 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 LATO43561 262 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 IL1BP01584 269 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 DRD3P35462 400 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 GABRB2P47870 512 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 C21orf59P57076 290 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 CENPCQ03188 943 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 NME3Q13232 169 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 KCNJ12Q14500 433 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM35BQ8NCS4 154 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A13Q9UJS0 675 aa21.59■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 LAMA5O15230 3695 aa21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GTQ1 180 aa21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 TNFSF14O43557 240 aa21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 PAGE1O75459 146 aa21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 VAV1P15498 845 aa21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 CXCR3P49682 368 aa21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 CDH4P55283 916 aa21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 OR52K2Q8NGK3 314 aa21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 OR8D1Q8WZ84 308 aa21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 PIGVQ9NUD9 493 aa21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.58■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa21.58■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PR77 199 aa21.57■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 YKT6O15498 198 aa21.57■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 F9P00740 461 aa21.57■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 CYP11B1P15538 503 aa21.57■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 CD38P28907 300 aa21.57■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 NUDT1P36639 197 aa21.57■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 IRAK1P51617 712 aa21.57■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 FAM46CQ5VWP2 391 aa21.57■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 PROSER1Q86XN7 944 aa21.57■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.57■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 OR14C36Q8NHC7 312 aa21.57■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.57■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 HS3ST2Q9Y278 367 aa21.57■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 MCF2LO15068 1137 aa21.56■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 WNT1P04628 370 aa21.56■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 KCNMA1Q12791 1236 aa21.56■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.56■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF683Q8IZ20 524 aa21.56■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 TKTL2Q9H0I9 626 aa21.56■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 WDCPQ9H6R7 721 aa21.56■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 VPS28Q9UK41 221 aa21.56■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 PPM1HQ9ULR3 514 aa21.56■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.56■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 KCNK3O14649 394 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 ADCY5O95622 1261 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 SULT1E1P49888 294 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 SCAPQ12770 1279 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 SLC45A4Q5BKX6 768 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 ARCQ7LC44 396 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 BNIPLQ7Z465 357 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 C14orf80Q86SX3 495 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 GALNT15Q8N3T1 639 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 C18orf8Q96DM3 657 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf74Q96LT6 269 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 ANLNQ9NQW6 1124 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 GDF3Q9NR23 364 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 SARDHQ9UL12 918 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 DMTF1Q9Y222 760 aa21.55■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 DRGXA6NNA5 263 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 I6L893 689 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 UCHL3P15374 230 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 GGCXP38435 758 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 PPP2CBP62714 309 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 PPP2CAP67775 309 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 KRT83P78385 493 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 DLG2Q15700 870 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 AGBL4Q5VU57 503 aa21.54■■□□□ 1.04
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