RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412172.3

PPP4R3CP-201, Transcript of Putative SMEK homolog 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene PPP4R3CP, Length 3,131 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R3CP-201ENST00000412172 BDP1A6H8Y1 2624 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 K7ERQ8 282 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 GREM1O60565 184 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 HLA-FP30511 346 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 DGKGP49619 791 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 STK19P49842 368 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 AIF1P55008 147 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 CDH4P55283 916 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 COPS2P61201 443 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 LMAN2Q12907 356 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 EML3Q32P44 896 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 C8orf74Q6P047 294 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 MTSS1LQ765P7 747 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 C12orf40Q86WS4 652 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 CEP112Q8N8E3 955 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 SUSD6Q92537 303 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 UBXN4Q92575 508 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 ATP2A3Q93084 1043 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 NT5MQ9NPB1 228 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 ZNF510Q9Y2H8 683 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 WASH3PC4AMC7 463 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 APOC2P02655 101 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 FCARP24071 287 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 ADCY8P40145 1251 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 ARSEP51690 589 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 GAD2Q05329 585 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 DPYSQ14117 519 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 PDK1Q15118 436 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 PPP2R5EQ16537 467 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 GEN1Q17RS7 908 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 TTC27Q6P3X3 843 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 Q6ZNB5 142 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 CHST9Q7L1S5 443 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 ACTRT1Q8TDG2 376 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 LRRC1Q9BTT6 524 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 E7EVH7 732 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 DCLK1O15075 740 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 SLC4A1P02730 911 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 PRLRP16471 622 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 GJA4P35212 333 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 SCNN1BP51168 640 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 GDF10P55107 478 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 DR1Q01658 176 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 SEMA3BQ13214 749 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 PCSK7Q16549 785 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 CPA6Q8N4T0 437 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 ZNF276Q8N554 614 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 TTC13Q8NBP0 860 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 MAIP1Q8WWC4 291 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 APOL2Q9BQE5 337 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 FERMT1Q9BQL6 677 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 HPS4Q9NQG7 708 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 PLA2G4CQ9UP65 541 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 SNX24Q9Y343 169 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.3□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa7.29□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 ECEL1O95672 775 aa7.29□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 HLA-EP13747 358 aa7.29□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 MX2P20592 715 aa7.29□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 GKP32189 559 aa7.29□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 COILP38432 576 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 GUCY2DQ02846 1103 aa7.29□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 SLC10A7Q0GE19 358 aa7.29□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 GPS1Q13098 491 aa7.29□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 USP4Q13107 963 aa7.29□□□□□ -1.24
PPP4R3CP-201ENST00000412172 HTR4Q13639 388 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms