RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410938.1

RNU6-1328P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1328, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1328P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SCML4Q8N228 414 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CPXM2Q8N436 756 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SUPT20HQ8NEM7 779 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MOSPD2Q8NHP6 518 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GRK7Q8WTQ7 553 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SGCDQ92629 289 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC22A18Q96BI1 424 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PTERQ96BW5 349 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RNF31Q96EP0 1072 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HARBI1Q96MB7 349 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RUNDC3BQ96NL0 473 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 WDR24Q96S15 920 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IWS1Q96ST2 819 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MAP7D2Q96T17 732 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FAM118BQ9BPY3 351 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KIFC3Q9BVG8 833 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IFT27Q9BW83 186 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CDCP1Q9H5V8 836 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OPA3Q9H6K4 179 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SFXN1Q9H9B4 322 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PCMTD2Q9NV79 361 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C19orf73Q9NVV2 129 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OGFRQ9NZT2 677 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SELENONQ9NZV5 590 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 VPS51Q9UID3 782 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CD207Q9UJ71 328 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF112Q9UJU3 913 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ADAM29Q9UKF5 820 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RIMKLBQ9ULI2 386 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SNX14Q9Y5W7 946 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 AATKQ6ZMQ8 1374 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRBC2A0A5B9 178 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SYCE3A1L190 88 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 A1L4Q6 167 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C9orf118A6NHY6 69 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DIRC3C9JPN6 131 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 USP17L23D6RBM5 183 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 H0YAE9 185 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SNAP23O00161 211 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RFXAPO00287 272 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 WNT10BO00744 389 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ADAM20O43506 726 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TMPRSS11DO60235 418 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PEX10O60683 326 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PRAMEF10O60809 474 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 AVILO75366 819 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TACC1O75410 805 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 STC2O76061 302 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GOSR1O95249 250 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PGM3O95394 542 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ONECUT2O95948 504 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PNPP00491 289 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HLA-DQA2P01906 255 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TUBB4AP04350 444 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TPOP07202 933 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CYP3A4P08684 503 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PRR35P0CG20 571 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PEPDP12955 493 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 EEF2P13639 858 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 P4HA1P13674 534 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PKMP14618 531 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC2A4P14672 509 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF28P17035 718 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CR2P20023 1033 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MATN1P21941 496 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KRT2P35908 639 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PRPHP41219 470 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GARSP41250 739 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GABRB2P47870 512 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CAMPP49913 170 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ALDH3A2P51648 485 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CLCN2P51788 898 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CDR1P51861 262 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ARF5P84085 180 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NHLH2Q02577 135 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms