RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAGEH1Q9H213 219 aa15.69■□□□□ 0.1
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD248Q9HCU0 757 aa15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP15.66■□□□□ 0.1
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF217O75362 1048 aa15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOT1P17174 413 aa15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERCC2P18074 760 aa15.65■□□□□ 0.1
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDH6P55285 790 aa15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NHLH1Q02575 133 aa15.65■□□□□ 0.1
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
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