RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 PILRBQ9UKJ0 227 aa8.74□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 CAPN11Q9UMQ6 739 aa8.74□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.74□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 PCNX2A6NKB5 2137 aa8.74□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 METTL12A8MUP2 240 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 SRGAP2O75044 1071 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 SIN3BO75182 1162 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 SYPP08247 313 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 RHOQP17081 205 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 C5AR1P21730 350 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 OR1E1P30953 314 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 L1CAMP32004 1257 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 PBX1P40424 430 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 PTGER3P43115 390 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 MAPKAPK2P49137 400 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM14Q14142 442 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 NUMA1Q14980 2115 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 EFHC2Q5JST6 749 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 STPG1Q5TH74 334 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 TRNP1Q6NT89 227 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 SLFN11Q7Z7L1 901 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF683Q8IZ20 524 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 DCAF4L2Q8NA75 395 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 JOSD2Q8TAC2 188 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM172AQ8WUF8 416 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 DNASE2BQ8WZ79 361 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 OR8D1Q8WZ84 308 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 ALG14Q96F25 216 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 GPR174Q9BXC1 333 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 TSPY26PQ9H489 355 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 FZD4Q9ULV1 537 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 SCINQ9Y6U3 715 aa8.73□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 LRRC72A6NJI9 287 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 MEI4A8MW99 385 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 TTC34A8MYJ7 566 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 MCF2LO15068 1137 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF8O76064 485 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 CNTN5O94779 1100 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 SERPING1P05155 500 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 TPM1P09493 284 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 GOT1P17174 413 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 ITPKAP23677 461 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 RRM1P23921 792 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 NUDT1P36639 197 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 HDAC4P56524 1084 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 MAMLD1Q13495 774 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 ACAP1Q15027 740 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 DLG2Q15700 870 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 CST6Q15828 149 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 CDO1Q16878 200 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 ACCSLQ4AC99 568 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 ALFQ53S48 1182 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 PLPP6Q8IY26 295 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 FRMD1Q8N878 549 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 GANCQ8TET4 914 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 PTPRN2Q92932 1015 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 MCEEQ96PE7 176 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM129BQ96TA1 746 aa8.72□□□□□ -1.01
MT-TS1-201ENST00000387416 EPAS1Q99814 870 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms