RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 MAGEA6P43360 314 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 RPS24P62847 133 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 CFAP52Q8N1V2 620 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 CPT1BQ92523 772 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 EXOC4Q96A65 974 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 IGSF9Q9P2J2 1179 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 TBC1D14Q9P2M4 693 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ILVBLA1L0T0 632 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 KCNK1O00180 336 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 PARP6Q2NL67 630 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 MPPE1Q53F39 396 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 TEX44Q53QW1 395 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKRD54Q6NXT1 300 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 TMC3Q7Z5M5 1100 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 NAT8LQ8N9F0 302 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 LRRN4Q8WUT4 740 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 MYEOVQ96EZ4 313 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 HMCESQ96FZ2 354 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 VIPAS39Q9H9C1 493 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 SP110Q9HB58 689 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 HAUS2Q9NVX0 235 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 MYO7AQ13402 2215 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 DOCK4Q8N1I0 1966 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 PPFIA2O75334 1257 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 CYBBP04839 570 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 FSHRP23945 695 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 USP4Q13107 963 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 CASP8Q14790 479 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 BBS7Q8IWZ6 715 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF567Q8N184 647 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 OTUB2Q96DC9 234 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ACBD3Q9H3P7 528 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 E7EVH7 732 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 TSPAN3O60637 253 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 GLP2RO95838 553 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 RHOCP08134 193 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 CCNB1P14635 433 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 TPSB2P20231 275 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 NRLP54845 237 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 OXCT1P55809 520 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 CDK16Q00536 496 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 GNA12Q03113 381 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 IL10RBQ08334 325 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 SEMA5AQ13591 1074 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 KCNJ11Q14654 390 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 TPSAB1Q15661 275 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 PID1Q7Z2X4 250 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF354CQ86Y25 554 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 MAML1Q92585 1016 aa25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 HELZP42694 1942 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 TBL1XO60907 577 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 NEBLO76041 1014 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 RENBPP51606 427 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 SERINC3Q13530 473 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF77Q15935 545 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 TTC16Q8NEE8 873 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ITFG1Q8TB96 612 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 TEKT5Q96M29 485 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF599Q96NL3 588 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 FUT8Q9BYC5 575 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ETNK1Q9HBU6 452 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF446Q9NWS9 450 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 GDE1Q9NZC3 331 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 CCL26Q9Y258 94 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 GOLGA6CA6NDK9 693 aa25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 GOLGA6BA6NDN3 693 aa25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 GOLGA6DP0CG33 693 aa25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ARL4CP56559 192 aa25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 SARNPP82979 210 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 RELL1Q8IUW5 271 aa25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ING5Q8WYH8 240 aa25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 IL12RB2Q99665 862 aa25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 GBA3Q9H227 469 aa25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms