RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 CCDC197Q8NCU1 140 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 FBXO36Q8NEA4 188 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 MPP6Q9NZW5 540 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 SPAG6O75602 509 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 DNAJB1P25685 340 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 IFNAR2P48551 515 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 KCNQ1P51787 676 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 GAD2Q05329 585 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 WASHC5Q12768 1159 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 IFT88Q13099 833 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 ITIH4Q14624 930 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 FBXL22Q6P050 247 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 ELMOD1Q8N336 334 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 ANKS4BQ8N8V4 417 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 C2orf78A6NCI8 922 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 FAM47DPA6NHR8 397 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 HIDE1A8MVS5 230 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 DFFAO00273 331 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 ACSL4O60488 711 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 CSPG5O95196 566 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 METTL18O95568 372 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 SLC11A2P49281 568 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 BBS9Q3SYG4 887 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 FAXCQ5TGI0 409 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 ANKRD42Q8N9B4 389 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 MGARPQ8TDB4 240 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 PPM1EQ8WY54 764 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 RASSF4Q9H2L5 321 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 IL21Q9HBE4 155 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 DRGXA6NNA5 263 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 ANKRD65E5RJM6 399 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 BANF1O75531 89 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 MYOGP15173 224 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 TPSB2P20231 275 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 TACR2P21452 398 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 PTPN3P26045 913 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 STX2P32856 288 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 SEMA5AQ13591 1074 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 TPSAB1Q15661 275 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 AFMIDQ63HM1 303 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 CCDC121Q6ZUS5 278 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 AZIN2Q96A70 460 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 MAGEB18Q96M61 343 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 SAMD11Q96NU1 681 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 TSGA13Q96PP4 275 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 VAT1Q99536 393 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 TRABDQ9H4I3 376 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 F5H5T6 163 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 KCNK1O00180 336 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 APRTP07741 180 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 KRT15P19012 456 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 SSTR1P30872 391 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 MPP2Q14168 576 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 LRRC14Q15048 493 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF567Q8N184 647 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 SMC6Q96SB8 1091 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 RNF38Q9H0F5 515 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.57■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.56■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 STC2O76061 302 aa20.56■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 ARHGEF15O94989 841 aa20.56■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 CCNCP24863 283 aa20.56■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 CLCN4P51793 760 aa20.56■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 NDST2P52849 883 aa20.56■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 PARP6Q2NL67 630 aa20.56■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.56■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.56■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 RTL10Q7L3V2 364 aa20.56■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 TAX1BP1Q86VP1 789 aa20.56■□□□□ 0.88
SUMO3-201ENST00000332859 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms