RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEU3Q9UQ49 428 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD62A6NC57 917 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFS2O75306 463 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 GYPCP04921 128 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 OXTRP30559 389 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 VASPP50552 380 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBED6P86452 979 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB16Q05516 673 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCAPQ12770 1279 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAMLD1Q13495 774 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRS2Q8WU20 508 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPRN2Q92932 1015 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR174Q9BXC1 333 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGEB5Q9BZ81 275 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 MUC3BQ9H195 1237 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR12D3Q9UGF7 316 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A13Q9UJS0 675 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0D9SEW6 157 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 LNP1A1A4G5 178 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM72CH0Y354 149 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNTTP04053 509 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 VAV1P15498 845 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPP6P42658 865 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf118Q5T5N4 469 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM124AQ86V42 546 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM72BQ86X60 149 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNPY3Q9BT09 278 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARVAQ9NVD7 372 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDH15Q96QU1 1955 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC30A4O14863 429 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP9BO43861 1147 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNAP91O60641 907 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTN2O75298 545 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRIG2O94898 1065 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 FTLP02792 175 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDHBP21912 280 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1E1P30953 314 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXD12P35452 270 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 NNMTP40261 264 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIMK1P53667 647 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 STK40Q8N2I9 435 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 EDEM2Q9BV94 578 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS51Q9UID3 782 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACNA1EQ15878 2313 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAMA1P25391 3075 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ILVBLA1L0T0 632 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPM3P06753 285 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACSL1P33121 698 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 CST6Q15828 149 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM61Q5EBN2 209 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMC6Q7Z403 805 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLFN11Q7Z7L1 901 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 NLRP14Q86W24 1093 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 DRC7Q8IY82 874 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF214Q8ND24 703 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 CADM4Q8NFZ8 388 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR7D4Q8NG98 312 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXJ1Q92949 421 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF653Q96CK0 615 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM129BQ96TA1 746 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTKNQ9BST9 563 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ISCUQ9H1K1 167 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPTBN2O15020 2390 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEI4A8MW99 385 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPING1P05155 500 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRCP12931 536 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLDCP23378 1020 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 CASP14P31944 242 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMD8P48556 350 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT83P78385 493 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms