RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 HAUS2Q9NVX0 235 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 TBC1D14Q9P2M4 693 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 NEU3Q9UQ49 428 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 NEU2Q9Y3R4 380 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 DOCK8Q8NF50 2099 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 C5orf60A6NFR6 353 aa18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 GJA1P17302 382 aa18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 CCNCP24863 283 aa18.48■□□□□ 0.55
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SYNE4-201ENST00000324444 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ANO4Q32M45 955 aa18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 STXBP5Q5T5C0 1151 aa18.48■□□□□ 0.55
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SYNE4-201ENST00000324444 Q6ZNB5 142 aa18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 C14orf80Q86SX3 495 aa18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 NLRP14Q86W24 1093 aa18.48■□□□□ 0.55
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SYNE4-201ENST00000324444 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 EPC1Q9H2F5 836 aa18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 KCNK12Q9HB15 430 aa18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
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SYNE4-201ENST00000324444 LEFTY2O00292 366 aa18.47■□□□□ 0.55
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SYNE4-201ENST00000324444 GGCXP38435 758 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 AP1B1Q10567 949 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 MPP7Q5T2T1 576 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 C6orf118Q5T5N4 469 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF783Q6ZMS7 281 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 FAM217AQ8IXS0 508 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ATPAF2Q8N5M1 289 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 FAM71DQ8N9W8 422 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 NSMCE1Q8WV22 266 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 FATE1Q969F0 183 aa18.47■□□□□ 0.55
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SYNE4-201ENST00000324444 KCNH6Q9H252 994 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 DPH5Q9H2P9 285 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 USP29Q9HBJ7 922 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 CFAP97Q9P2B7 532 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 TRHDEQ9UKU6 1024 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 OPHN1O60890 802 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 RAMP2O60895 175 aa18.46■□□□□ 0.55
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SYNE4-201ENST00000324444 FSHRP23945 695 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 OR1E1P30953 314 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
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SYNE4-201ENST00000324444 POTEHQ6S545 545 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 IGSF8Q969P0 613 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 KLC2Q9H0B6 622 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 MAGEH1Q9H213 219 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 GDE1Q9NZC3 331 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 MPP6Q9NZW5 540 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 IGSF9Q9P2J2 1179 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.46■□□□□ 0.55
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SYNE4-201ENST00000324444 SNX24Q9Y343 169 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 PIEZO1Q92508 2521 aa18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 DFFAO00273 331 aa18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 RPL21P46778 160 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 CARSP49589 748 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 GPS1Q13098 491 aa18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 MORF4L2Q15014 288 aa18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 TMCO4Q5TGY1 634 aa18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 HOOK3Q86VS8 718 aa18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 NPWQ8N729 165 aa18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 ITFG1Q8TB96 612 aa18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 SH3RF2Q8TEC5 729 aa18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 E2F7Q96AV8 911 aa18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 ANAPC5Q9UJX4 755 aa18.45■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 A0A0A0MRY4 1105 aa18.44■□□□□ 0.54
SYNE4-201ENST00000324444 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa18.44■□□□□ 0.54
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