RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301730.12

RNPS1-201, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,276 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-201ENST00000301730 THADAQ6YHU6 1953 aa21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 A0A0D9SEW6 157 aa21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 TTC34A8MYJ7 566 aa21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 AKR1B10O60218 316 aa21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF217O75362 1048 aa21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 LRCH4O75427 683 aa21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 C7P10643 843 aa21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 VASPP50552 380 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 SEMA3BQ13214 749 aa21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 PMS2CLQ68D20 193 aa21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF783Q6ZMS7 281 aa21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 DCLK2Q8N568 766 aa21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 FBRSQ9HAH7 460 aa21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 TMEM248Q9NWD8 314 aa21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 ILVBLA1L0T0 632 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 RETP07949 1114 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 MIPP30301 263 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 MAPKAPK2P49137 400 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 ACAP1Q15027 740 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 ELF2Q15723 593 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 DCAF4L2Q8NA75 395 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 SIPA1Q96FS4 1042 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 LOXL4Q96JB6 756 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 CCDC42Q96M95 316 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 NCAPGQ9BPX3 1015 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 HINFPQ9BQA5 517 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 PACSIN1Q9BY11 444 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 NDFIP2Q9NV92 336 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 PCSK1NQ9UHG2 260 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 SLC25A13Q9UJS0 675 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 ANAPC7Q9UJX3 599 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 AP4E1Q9UPM8 1137 aa21.19■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 SNAP91O60641 907 aa21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 SIN3BO75182 1162 aa21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 RHOBTB1O94844 696 aa21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 PCK1P35558 622 aa21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 NNMTP40261 264 aa21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 GNA12Q03113 381 aa21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 C9orf64Q5T6V5 341 aa21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 CACUL1Q86Y37 369 aa21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 OR7D4Q8NG98 312 aa21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 EPAS1Q99814 870 aa21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 ITM2CQ9NQX7 267 aa21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 VPS51Q9UID3 782 aa21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 CYP8B1Q9UNU6 501 aa21.18■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 CREB3O43889 395 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 PRPSAP2O60256 369 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 EPN2O95208 641 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 EPHB2P29323 1055 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 KRT83P78385 493 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 CA9Q16790 459 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 FRS2Q8WU20 508 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 PTPRN2Q92932 1015 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 BTBD6Q96KE9 485 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 IP6K2Q9UHH9 426 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 DNAI1Q9UI46 699 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 USP18Q9UMW8 372 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 HS3ST2Q9Y278 367 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 CFAP54Q96N23 3096 aa21.17■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 ATP9BO43861 1147 aa21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 H2AFZP0C0S5 128 aa21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 VAV1P15498 845 aa21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 GLDCP23378 1020 aa21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 HTR7P34969 479 aa21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 TPMTP51580 245 aa21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 RPS14P62263 151 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 H2AFVQ71UI9 128 aa21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 ATP13A1Q9HD20 1204 aa21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 UVRAGQ9P2Y5 699 aa21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa21.16■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
RNPS1-201ENST00000301730 WASH4PA8MWX3 477 aa21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms