RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF280CQ8ND82 737 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LRTOMTQ8WZ04 291 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TAMM41Q96BW9 452 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PSD2Q9BQI7 771 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRPV6Q9H1D0 765 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KMT5AQ9NQR1 393 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SEPT3Q9UH03 358 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DOCK1Q14185 1865 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ICAM1P05362 532 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CD1EP15812 388 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYF6P23409 242 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRIM16LQ309B1 348 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COLGALT2Q8IYK4 626 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RNF148Q8N7C7 305 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MXRA8Q9BRK3 442 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C1orf50Q9BV19 199 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DRC3Q9H069 523 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RNPEPQ9H4A4 650 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF385DQ9H6B1 395 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
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TRAPPC2L-201ENST00000301021 AKAP10O43572 662 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EXTL3O43909 919 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 VAPBO95292 243 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HSPA4LO95757 839 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 APRTP07741 180 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.51e-7■■■□□ 17.8
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TRAPPC2L-201ENST00000301021 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MTX3Q5HYI7 312 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GPR107Q5VW38 600 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC15A4Q8N697 577 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CNTD1Q8N815 330 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDPRQ8NCN5 879 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ACDQ96AP0 544 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AS3MTQ9HBK9 375 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CORINQ9Y5Q5 1042 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C9IYK1 514 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADM5C9JUS6 153 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 H7C0C1 242 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 J3QRK9 145 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PFDN6O15212 129 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GCATO75600 419 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 USP2O75604 605 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATP5OP48047 213 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAB39AQ14964 217 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PHKG1Q16816 387 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM47CQ5HY64 1035 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TTC30AQ86WT1 665 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF786Q8N393 782 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SAMD3Q8N6K7 520 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATP6V0A1Q93050 837 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FBXL8Q96CD0 374 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MROQ9BYG7 248 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM216Q9P0N5 145 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ALDH1A2O94788 518 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CSPG5O95196 566 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC7A1P30825 629 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HK2P52789 917 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CD300CQ08708 224 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PMS2P3Q13401 168 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TFDP2Q14188 446 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NPNTQ6UXI9 565 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C4orf19Q8IY42 314 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PACRGLQ8N7B6 248 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANKFN1Q8N957 763 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MFSD2AQ8NA29 543 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NSMCE3Q96MG7 304 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CALN1Q9BXU9 219 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NACA2Q9H009 215 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KCNN4O15554 427 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DHX15O43143 795 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NOL3O60936 208 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KRT3P12035 628 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GSSP48637 474 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NIPAL4Q0D2K0 466 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NFATC3Q12968 1075 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NAB1Q13506 487 aa18.17■□□□□ 0.5
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