RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa21.97■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 A0A1B0GVG6 124 aa21.97■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 LPXNO60711 386 aa21.97■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 T-ENOLP0DO92 83 aa21.97■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 MGAT1P26572 445 aa21.97■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 LRRC8BQ6P9F7 803 aa21.97■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.97■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 NUDT5Q9UKK9 219 aa21.97■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 PTPN4P29074 926 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 OLIG2Q13516 323 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 BMPR2Q13873 1038 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 FOXB2Q5VYV0 432 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 AGAP3Q96P47 875 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 TNFRSF10BO14763 440 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 MLNP12872 115 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 FAM189BP81408 668 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 UNC5BQ8IZJ1 945 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 APOPT1Q96IL0 206 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 GBP5Q96PP8 586 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 PHTF1Q9UMS5 762 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 RAD54BQ9Y620 910 aa21.96■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 SDR42E2A6NKP2 422 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 TM9SF1O15321 606 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 NCAM2O15394 837 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 IRAK2O43187 625 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 KRT37O76014 449 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 PHC3Q8NDX5 983 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 PTPRN2Q92932 1015 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 TTC3P53804 2025 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 FAM159BA6NKW6 160 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 IGLV3-25P01717 112 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 SERPINB6P35237 376 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 GPR15P49685 360 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 CASP10Q92851 521 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 VCX3BQ9H321 246 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 VCX3AQ9NNX9 186 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 ZNF180Q9UJW8 692 aa21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 SHROOM3Q8TF72 1996 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 ARVCFO00192 962 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 TADA2AO75478 443 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 MX2P20592 715 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 GARSP41250 739 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 GALNT2Q10471 571 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 ZBTB17Q13105 803 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 ZNF449Q6P9G9 518 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 RGS9BPQ6ZS82 235 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 SCD5Q86SK9 330 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 NMUR1Q9HB89 426 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 SYBUQ9NX95 663 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 NUP205Q92621 2012 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 A0A1W2PQH9 124 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 TTC36A6NLP5 189 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 USP12O75317 370 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 OAZ2O95190 189 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 SLC18A2Q05940 514 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 DDR2Q16832 855 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 ARMC3Q5W041 872 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 SH2D5Q6ZV89 423 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 GATA6Q92908 595 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 HDAC11Q96DB2 347 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 SAR1AQ9NR31 198 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 SLC17A6Q9P2U8 582 aa21.94■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 GRK4P32298 578 aa21.93■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 NEK3P51956 506 aa21.93■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 GSTA3Q16772 222 aa21.93■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 LGSNQ5TDP6 509 aa21.93■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 TRIM74Q86UV6 250 aa21.93■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 TRIM73Q86UV7 250 aa21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms