RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
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HPS6-201ENST00000299238 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 LRRC39Q96DD0 335 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
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HPS6-201ENST00000299238 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
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HPS6-201ENST00000299238 ADORA2BP29275 332 aa20.61■□□□□ 0.89
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HPS6-201ENST00000299238 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.61■□□□□ 0.89
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HPS6-201ENST00000299238 PMLP29590 882 aa20.61■□□□□ 0.89
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HPS6-201ENST00000299238 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.61■□□□□ 0.89
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HPS6-201ENST00000299238 SLC26A7Q8TE54 656 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 PPP4R1Q8TF05 950 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 SH3PXD2BA1X283 911 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 PIRO00625 290 aa20.6■□□□□ 0.89
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HPS6-201ENST00000299238 C4orf22Q6V702 233 aa20.6■□□□□ 0.89
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HPS6-201ENST00000299238 AP1G1O43747 822 aa20.59■□□□□ 0.89
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HPS6-201ENST00000299238 SNX17Q15036 470 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 C6orf183Q5T699 404 aa20.59■□□□□ 0.89
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HPS6-201ENST00000299238 POU5F2Q8N7G0 328 aa20.59■□□□□ 0.89
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HPS6-201ENST00000299238 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa20.59■□□□□ 0.89
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HPS6-201ENST00000299238 BST1Q10588 318 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 TGFBIQ15582 683 aa20.59■□□□□ 0.89
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HPS6-201ENST00000299238 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.59■□□□□ 0.89
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HPS6-201ENST00000299238 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 A0A1B0GTW7 788 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 CD4P01730 458 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 AXLP30530 894 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 TMPRSS15P98073 1019 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 APBB2Q92870 758 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 RNF39Q9H2S5 420 aa20.58■□□□□ 0.89
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