RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 ETNK2Q9NVF9 386 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 OR12D3Q9UGF7 316 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 TGDSO95455 350 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 IL1BP01584 269 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 EPB42P16452 691 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 IFNAR2P48551 515 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 ANKS6Q68DC2 871 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 MYLPFQ96A32 169 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 TCF12Q99081 682 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 MAGEH1Q9H213 219 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 ACP6Q9NPH0 428 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 DYTNA2CJ06 578 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 CHKAP35790 457 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 GRM3Q14832 879 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 DOCK1Q14185 1865 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 KRT87PA6NCN2 255 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 SERPINB8P50452 374 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 TEX44Q53QW1 395 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 PCID2Q5JVF3 399 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 CLEC20AQ6ZU45 233 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 MAML1Q92585 1016 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 FAM153AQ9UHL3 310 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 H3BMM5 538 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 RAMP2O60895 175 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 EPHB3P54753 998 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 CKAP2Q8WWK9 683 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 RNF103O00237 685 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 FGF1P05230 155 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 MAPK9P45984 424 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 MPP3Q13368 585 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 FLOT2Q14254 428 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC153Q494R4 210 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 GRTP1Q5TC63 336 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 NT5C3BQ969T7 300 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 CPNE1Q99829 537 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM121Q9BTD3 319 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 CHUKO15111 745 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 MPOP05164 745 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 FGFR4P22455 802 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 KLRC2P26717 231 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 RAP1GAPP47736 663 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 FCRL5Q96RD9 977 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 CHN1P15882 459 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 DSC1Q08554 894 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 HECTD3Q5T447 861 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM199Q8N511 208 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 CPT1BQ92523 772 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 ZYG11BQ9C0D3 744 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 KCTD5Q9NXV2 234 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 MYH15Q9Y2K3 1946 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 RPL26P61254 145 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 SLC20A2Q08357 652 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 SNX31Q8N9S9 440 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 KLHL29Q96CT2 875 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPN3-201ENST00000262539 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms