RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 LRRC1Q9BTT6 524 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 GTSE1Q9NYZ3 720 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 TTI1O43156 1089 aa26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 ADH5P11766 374 aa26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 ETS1P14921 441 aa26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 GLDCP23378 1020 aa26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 CD70P32970 193 aa26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 CSKP41240 450 aa26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 PTGIRP43119 386 aa26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 AAK1Q2M2I8 961 aa26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 SLC45A4Q5BKX6 768 aa26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 MPP7Q5T2T1 576 aa26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 RNF43Q68DV7 783 aa26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 C12orf40Q86WS4 652 aa26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 FAM71DQ8N9W8 422 aa26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 ATP2A3Q93084 1043 aa26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 CEP41Q9BYV8 373 aa26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 SGK1O00141 431 aa26.71■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 LMAN2Q12907 356 aa26.71■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 PDGFRLQ15198 375 aa26.71■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 KIAA1958Q8N8K9 716 aa26.71■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 TRIM51Q9BSJ1 452 aa26.71■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 SPON2Q9BUD6 331 aa26.71■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 MUC3BQ9H195 1237 aa26.71■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 EPC1Q9H2F5 836 aa26.71■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 ECT2Q9H8V3 914 aa26.71■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 MARK1Q9P0L2 795 aa26.71■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 J3KR12 359 aa26.7■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 KCNN4O15554 427 aa26.7■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 NFATC1O95644 943 aa26.7■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 ADH1CP00326 375 aa26.7■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 SLC7A5Q01650 507 aa26.7■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 DR1Q01658 176 aa26.7■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 XRCC4Q13426 336 aa26.7■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 C8orf74Q6P047 294 aa26.7■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 USP29Q9HBJ7 922 aa26.7■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 SEPT10Q9P0V9 454 aa26.7■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 PCYOX1Q9UHG3 505 aa26.7■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 RAD54BQ9Y620 910 aa26.7■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 MIA3Q5JRA6 1907 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 ILVBLA1L0T0 632 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 KCNK1O00180 336 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 MAFKO60675 156 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 ITGAVP06756 1048 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 ASGR2P07307 311 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 RHOXF2BP0C7M4 288 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 MX2P20592 715 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 GAB4Q2WGN9 574 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 PARP15Q460N3 678 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 IL31Q6EBC2 164 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 GSTA5Q7RTV2 222 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 ALLCQ8N6M5 410 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 ATL2Q8NHH9 583 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 HDAC11Q96DB2 347 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 RHOXF2Q9BQY4 288 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 ABCB8Q9NUT2 735 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 DONSONQ9NYP3 566 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 ACTL7AQ9Y615 435 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa26.7■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 ARHGAP42A6NI28 874 aa26.69■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 IFNB1P01574 187 aa26.69■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 HLA-FP30511 346 aa26.69■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 SERINC3Q13530 473 aa26.69■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 APCDD1Q8J025 514 aa26.69■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 FIBINQ8TAL6 211 aa26.69■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 MAGEH1Q9H213 219 aa26.69■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 RETREG1Q9H6L5 497 aa26.69■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 ATP13A1Q9HD20 1204 aa26.69■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 MYO10Q9HD67 2058 aa26.69■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 CHADO15335 359 aa26.68■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 VPS41P49754 854 aa26.68■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 JAMLQ86YT9 394 aa26.68■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 USP33Q8TEY7 942 aa26.68■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 FEM1AQ9BSK4 669 aa26.68■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 KCNK12Q9HB15 430 aa26.68■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 OR51B4Q9Y5P0 310 aa26.68■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 HACD1B0YJ81 288 aa26.68■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 ARNTLO00327 626 aa26.68■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 NCAM2O15394 837 aa26.68■■□□□ 1.86
TOMM40-201ENST00000252487 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms