RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 POMKQ9H5K3 350 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 KCNK4Q9NYG8 393 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 MORF4L1Q9UBU8 362 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 SSR3Q9UNL2 185 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 A0A087X1B8 175 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 PGRMC2O15173 223 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 PON1P27169 355 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 CDK16Q00536 496 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 BHLHB9Q6PI77 547 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 RNF148Q8N7C7 305 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 ERGIC2Q96RQ1 377 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 MAP3K6O95382 1288 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 LYNP07948 512 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 FDX1P10109 184 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 ATF6P18850 670 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 GRIA3P42263 894 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 FNBP1LQ5T0N5 605 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 LEMD2Q8NC56 503 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 BORCS5Q969J3 196 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 A0A088AWK7 358 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 FAM196BA6NMK8 535 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 COX7A2P14406 83 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 TNNI3P19429 210 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 BCAT1P54687 386 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 MYBPC1Q00872 1141 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 LDHDQ86WU2 507 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 GIPC3Q8TF64 312 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 SH2D3AQ9BRG2 576 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 EHD1Q9H4M9 534 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 TUBA4AP68366 448 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 RPL19P84098 196 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 TOMM20Q15388 145 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 HKDC1Q2TB90 917 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 TEX47Q8TBZ9 253 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 CLIC5Q9NZA1 410 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 FLT1P17948 1338 aa9.41□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 LSM8O95777 96 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 CRATP43155 626 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 ALDH3A2P51648 485 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 BMPR2Q13873 1038 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 IL18Q14116 193 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 HTRA1Q92743 480 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 SNX7Q9UNH6 387 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 FBXO21O94952 628 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 MAPK9P45984 424 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 PIK3CGP48736 1102 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 NAB1Q13506 487 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 GALNT3Q14435 633 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 ISLR2Q6UXK2 745 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 ZNF615Q8N8J6 731 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 APOL2Q9BQE5 337 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 PTGFRNQ9P2B2 879 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 NUP50Q9UKX7 468 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 H3BQF6 201 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 ITGB3P05106 788 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 ALADP13716 330 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 CDC25CP30307 473 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 IL18R1Q13478 541 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 SQLEQ14534 574 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 CBWD3Q5JTY5 395 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 CBWD5Q5RIA9 395 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 GPSM1Q86YR5 675 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 TMEM159Q96B96 161 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 OSBPL11Q9BXB4 747 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 PCDH9Q9HC56 1237 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 UBP1Q9NZI7 540 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 CHD5Q8TDI0 1954 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 A0A0G2JPF8 293 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 A0A1W2PQ72 361 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 FAM172BPA6NC97 362 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 H7C4K7 107 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 SDC2P34741 201 aa9.4□□□□□ -0.9
TNS1-201ENST00000171887 MYBPC3Q14896 1274 aa9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms