RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ephb2P54763 986 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prickle1Q3U5C7 832 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lsmem1Q3UQS2 128 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Klhl23Q6GQU2 558 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Efr3bQ6ZQ18 817 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1057Q7TR75 315 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mis18bp1Q80WQ8 998 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrsam1Q80ZI6 727 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zbtb42Q811H0 420 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q8BGD0 127 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Heatr3Q8BQM4 679 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MmaaQ8C7H1 415 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scara5Q8K299 491 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn1r206Q8R277 312 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppp6r2Q8R3Q2 923 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cadm1Q8R5M8 456 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Caap1Q8VDY9 356 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcdha10Q91Y20 946 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trip4Q9QXN3 581 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cacna1gQ5SUF7 2381 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plce1Q8K4S1 2282 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 IqccA2ADZ8 418 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mucl2P02815 138 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Il2P04351 169 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tcp1P11983 556 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 LmnaP48678 665 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plk2P53351 682 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Emilin3P59900 758 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccndbp1Q3TVC7 356 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ermp1Q3UVK0 898 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tubal3Q3UX10 446 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ThrspQ62264 150 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rxfp1Q6R6I7 758 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tbx10Q810F8 385 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm5622Q810Q0 167 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kctd13Q8BGV7 329 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bnc2Q8BMQ3 1127 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc43a1Q8BSM7 564 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 C130026I21RikQ8C898 291 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ugt3a2Q8JZZ0 523 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc30a5Q8R4H9 761 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Neto1Q8R4I7 533 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Apol9aQ8VDU3 310 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr342Q8VGK7 312 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ubxn6Q99PL6 442 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sar1bQ9CQC9 198 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam114a1Q9D281 569 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slco6d1Q9D5W6 683 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 FastkQ9JIX9 511 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Asap1Q9QWY8 1147 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scnn1gQ9WU39 655 aa22.38■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igkv5-39A0A0G2JDV4 115 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nxpe3B9EKK6 559 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 BC051665E9Q623 330 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mrgprx2Q3UG50 352 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam189bQ5HZJ5 669 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Luc7l3Q5SUF2 432 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Foxj1Q61660 421 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pum1Q80U78 1189 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppm1kQ8BXN7 372 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cfap36Q8C6E0 343 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smim14Q91VT8 99 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dcp2Q9CYC6 422 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Thumpd2Q9CZB3 528 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tsga13Q9DA17 273 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 D7h11orf16Q9JJR6 402 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem59Q9QY73 323 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Chrna6Q9R0W9 494 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ate1Q9Z2A5 516 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ggt5Q9Z2A9 573 aa22.37■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp985A2A7A5 519 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atp8b4A2ANX3 1194 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn1r55E9Q8I6 310 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fgf15O35622 218 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TecP24604 630 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mapkapk2P49138 386 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trmt10cQ3UFY8 414 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm853Q3UNZ2 425 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ManeaQ6NXH2 462 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Frmd4aQ8BIE6 1020 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc6a17Q8BJI1 727 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fra10ac1Q8BP78 315 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stx16Q8BVI5 326 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prr33Q8C494 260 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sept10Q8C650 452 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sash3Q8K352 380 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 OafQ8QZR4 282 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr697Q8VFM4 317 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SfpqQ8VIJ6 699 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tfap2dQ91ZK0 452 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 March2Q99M02 246 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm28919A0A087WP35 240 aa22.35■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm5814J3QP80 125 aa22.35■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zp3P10761 424 aa22.35■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PdgfraP26618 1089 aa22.35■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hsd17b2P51658 381 aa22.35■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pabpc2Q62029 628 aa22.35■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Irak1Q62406 710 aa22.35■■□□□ 1.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ntrk3Q6VNS1 825 aa22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.8 ms