RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	PCK1	P35558	622 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ARHGAP25	P42331	645 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	LMAN2	Q12907	356 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	FUT11	Q495W5	492 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	EFHC2	Q5JST6	749 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	TERB1	Q8NA31	727 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	C1orf74	Q96LT6	269 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ACOX2	Q99424	681 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	FBXO10	Q9UK96	956 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	DRGX	A6NNA5	263 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MAN2B1	O00754	1011 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	L1CAM	P32004	1257 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	CSK	P41240	450 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MMRN1	Q13201	1228 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	CDH18	Q13634	790 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	C5orf22	Q49AR2	442 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	C2orf27A	Q580R0	203 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	APCDD1	Q8J025	514 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	SHD	Q96IW2	340 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	GGA2	Q9UJY4	613 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634		A0A0D9SEW6	157 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634		A0A1B0GVM2	712 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634		H0Y626	953 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	AOC1	P19801	751 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	WAS	P42768	502 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	KRT83	P78385	493 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	NLRP14	Q86W24	1093 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	FBXL6	Q8N531	539 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	DNAI1	Q9UI46	699 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	WASH3P	C4AMC7	463 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	APOD	P05090	189 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	GLDC	P23378	1020 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	EPHB2	P29323	1055 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MAN1A1	P33908	653 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	TIE1	P35590	1138 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	GRIA2	P42262	883 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MTAP	Q13126	283 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ACAP1	Q15027	740 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	LLGL1	Q15334	1064 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MPP7	Q5T2T1	576 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	LRRC31	Q6UY01	552 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	CHST9	Q7L1S5	443 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	DAAM2	Q86T65	1068 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ALLC	Q8N6M5	410 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	NPW	Q8N729	165 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF366	Q8N895	744 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	OR7D4	Q8NG98	312 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	RAPGEF5	Q92565	580 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	KRT35	Q92764	455 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MSANTD3	Q96H12	275 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	CIPC	Q9C0C6	399 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61

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