RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640615.1

HLA-B-258, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

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Gene HLA-B, Length 240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-258ENST00000640615 SLC35B2Q8TB61 432 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 LRRN4Q8WUT4 740 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 OSCP1Q8WVF1 389 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 IRF7Q92985 503 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 OTUB2Q96DC9 234 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 ZFYVE19Q96K21 471 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 KXD1Q9BQD3 176 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 SLC39A8Q9C0K1 460 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 KLC2Q9H0B6 622 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 RETREG1Q9H6L5 497 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 C10orf88Q9H8K7 445 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 SPHK2Q9NRA0 654 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 NDFIP2Q9NV92 336 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 PLK2Q9NYY3 685 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 AMACRQ9UHK6 382 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 RAD54BQ9Y620 910 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 NOTCH4Q99466 2003 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 A0A1B0GVM2 712 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 ARHGAP42A6NI28 874 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 HACD1B0YJ81 288 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 RASA4BC9J798 803 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 SGK1O00141 431 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 NCAM2O15394 837 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 RASA4O43374 803 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 ECEL1O95672 775 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 ITGAVP06756 1048 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 RHOCP08134 193 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 ARSAP15289 507 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 DR1Q01658 176 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 LMNB2Q03252 620 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 GALNT2Q10471 571 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 AP1B1Q10567 949 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 XRCC4Q13426 336 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 CDH18Q13634 790 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 GRM2Q14416 872 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 DHCR24Q15392 516 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 EML3Q32P44 896 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 LY6G5CQ5SRR4 150 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 MPP7Q5T2T1 576 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 FYB2Q5VWT5 728 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 AFMIDQ63HM1 303 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 TRIM68Q6AZZ1 485 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 C8orf74Q6P047 294 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 MTSS1LQ765P7 747 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 MFN1Q8IWA4 741 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 MFSD6LQ8IWD5 586 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 ATPAF2Q8N5M1 289 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 GRK7Q8WTQ7 553 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 RSAD2Q8WXG1 361 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 UBXN4Q92575 508 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 FGF14Q92915 247 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 OLFM3Q96PB7 478 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 LGMNQ99538 433 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 TMEM121Q9BTD3 319 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 SPON2Q9BUD6 331 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 BBS2Q9BXC9 721 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 EBF3Q9H4W6 596 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.973e-12■■□□□ 11.4
HLA-B-258ENST00000640615 PCYOX1Q9UHG3 505 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 OBSL1O75147 1896 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 DOCK6Q96HP0 2047 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 ILVBLA1L0T0 632 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 KCNN4O15554 427 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 TTI1O43156 1089 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 RAD51CO43502 376 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 GPR37L1O60883 481 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 ECI2O75521 394 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 NFATC1O95644 943 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 GAS8O95995 478 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 ADH1CP00326 375 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-258ENST00000640615 RHOXF2BP0C7M4 288 aa8.98□□□□□ -0.97
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