RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	CLCNKB	P51801	687 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	AQP4	P55087	323 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	FOLH1	Q04609	750 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	WSCD1	Q658N2	575 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ATG16L1	Q676U5	607 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PACS1	Q6VY07	963 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	APBB2	Q92870	758 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	APOPT1	Q96IL0	206 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	AK5	Q9Y6K8	562 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	GABRD	O14764	452 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	AOC1	P19801	751 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PTPN7	P35236	360 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	FDFT1	P37268	417 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	SLC6A3	Q01959	620 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	GSTM4	Q03013	218 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	DLG1	Q12959	904 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	NADK2	Q4G0N4	442 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	KLHL35	Q6PF15	583 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PWWP2A	Q96N64	755 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	CORO1B	Q9BR76	489 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	CNPY3	Q9BT09	278 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	HAUS8	Q9BT25	410 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	LPXN	O60711	386 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	CAPN15	O75808	1086 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	GABBR2	O75899	941 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	USP1	O94782	785 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	SERPINA6	P08185	405 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PDGFRA	P16234	1089 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	LZTS1	Q9Y250	596 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		15.68	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659		H3BNX3	289 aa		15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ARVCF	O00192	962 aa		15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	FAM155B	O75949	473 aa		15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PGM3	O95394	542 aa		15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	IL1R2	P27930	398 aa		15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	MIP	P30301	263 aa		15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ETV4	P43268	484 aa		15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	COG7	P83436	770 aa		15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	MZB1	Q8WU39	189 aa		15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ABHD8	Q96I13	439 aa		15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		15.67	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		15.66	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659		A0A088AWK7	358 aa		15.66	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	WDR91	A4D1P6	747 aa		15.66	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	KBTBD13	C9JR72	458 aa		15.66	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	TXNDC9	O14530	226 aa		15.66	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	DPYSL4	O14531	572 aa		15.66	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	GRAP2	O75791	330 aa		15.66	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	POMC	P01189	267 aa		15.66	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	CD48	P09326	243 aa		15.66	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	KRT10	P13645	584 aa		15.66	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	CDKN2B	P42772	138 aa		15.66	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ACADSB	P45954	432 aa		15.66	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	LHX1	P48742	406 aa		15.66	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	NUP107	P57740	925 aa		15.66	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	HTRA3	P83110	453 aa		15.66	■□□□□ 0.1

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