RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 PDGFRAP16234 1089 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC9A1P19634 815 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 KCNJ12Q14500 433 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 MARCH9Q86YJ5 346 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 DEFB106AQ8N104 65 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 CPXM1Q96SM3 734 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 A0A1B0GTQ1 180 aa21.43■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-208ENST00000616074 ADH1BP00325 375 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 VAV1P15498 845 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP8P40818 1118 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 ADPRHP54922 357 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC12A1Q13621 1099 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 DDIT4Q9NX09 232 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 COX16Q9P0S2 106 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 WNT9AO14904 365 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 IL1BP01584 269 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 GOT1P17174 413 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 ABCB4P21439 1286 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 C5AR1P21730 350 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 CDK17Q00537 523 aa21.42■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-208ENST00000616074 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 PASD1Q8IV76 773 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 OR14C36Q8NHC7 312 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM81BQ96LP2 452 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 GPSM3Q9Y4H4 160 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 A0A1B0GVM2 712 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 TCAF2A6NFQ2 919 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 DFNA5O60443 496 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 GRAP2O75791 330 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 GLI1P08151 1106 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC2A3P11169 496 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCR1P32246 355 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 DRD3P35462 400 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 NNMTP40261 264 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCR5P51681 352 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLK1P53350 603 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 METAP1P53582 386 aa21.41■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-208ENST00000616074 INAVAQ3KP66 663 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 RABGAP1LQ5R372 815 aa21.41■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-208ENST00000616074 SHC3Q92529 594 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 RNF34Q969K3 372 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 FTSJ1Q9UET6 329 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 PCDHGC3Q9UN70 934 aa21.41■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-208ENST00000616074 ACACAQ13085 2346 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 LOC400499M0QZD8 3231 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 A0A1W2PR77 199 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 HSF2BPO75031 334 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 CD38P28907 300 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 IRAK1P51617 712 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP2CBP62714 309 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP2CAP67775 309 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 SULT2A1Q06520 285 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 SHBQ15464 509 aa21.4■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-208ENST00000616074 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 C19orf48Q6RUI8 117 aa21.4■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-208ENST00000616074 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 OR52K2Q8NGK3 314 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 FRS2Q8WU20 508 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 SKA1Q96BD8 255 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-208ENST00000616074 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM149AA5PLN7 773 aa21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLK4O00444 970 aa21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC3-208ENST00000616074 GGCXP38435 758 aa21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC3-208ENST00000616074 AUHQ13825 339 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC3-208ENST00000616074 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC3-208ENST00000616074 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC3-208ENST00000616074 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM131CQ96AQ9 280 aa21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC3-208ENST00000616074 ALG14Q96F25 216 aa21.39■■□□□ 1.01
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