RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593166.1

SLC25A39-217, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 3

Gene SLC25A39, Length 797 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-217ENST00000593166 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 DONSONQ9NYP3 566 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 MIA3Q5JRA6 1907 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 ILVBLA1L0T0 632 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 ZNF487B1APH4 448 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 ZSCAN12O43309 604 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 TIMM44O43615 452 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 PALMO75781 387 aa16.04■□□□□ 0.16
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SLC25A39-217ENST00000593166 CSKP41240 450 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 DPYSL3Q14195 570 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 PLEKHG6Q3KR16 790 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 FUT11Q495W5 492 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 TMEM215Q68D42 235 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 VSIG1Q86XK7 387 aa16.04■□□□□ 0.16
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SLC25A39-217ENST00000593166 OR52K2Q8NGK3 314 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 TTC17Q96AE7 1141 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 ALG14Q96F25 216 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 IER2Q9BTL4 223 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 CHRDQ9H2X0 955 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 LZTFL1Q9NQ48 299 aa16.04■□□□□ 0.16
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SLC25A39-217ENST00000593166 ELOVL2Q9NXB9 296 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 OR51B4Q9Y5P0 310 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 LRRD1A4D1F6 860 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 FAM86C2PA6NEL3 165 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 DAPK3O43293 454 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 RNF40O75150 1001 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 CD48P09326 243 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 ERCC2P18074 760 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 KDELR1P24390 212 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 CTNNA2P26232 953 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 ETFBP38117 255 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 E2F5Q15329 346 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 PITRM1Q5JRX3 1037 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 MBLAC2Q68D91 279 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 NT5DC3Q86UY8 548 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 KATNAL2Q8IYT4 538 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 KCTD6Q8NC69 237 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 USP33Q8TEY7 942 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 UCMAQ8WVF2 138 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 RAPGEF5Q92565 580 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 FAF2Q96CS3 445 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 FEM1AQ9BSK4 669 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 NDFIP2Q9NV92 336 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 KLHL11Q9NVR0 708 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 CCDC66A2RUB6 948 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 PRR33A8MZF0 331 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 DCLK1O15075 740 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 NPC1O15118 1278 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 PI15O43692 258 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 RAMP2O60895 175 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 KRT1P04264 644 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 ASLP04424 464 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 TNNT1P13805 278 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 MARCKSL1P49006 195 aa16.02■□□□□ 0.16
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SLC25A39-217ENST00000593166 GNA12Q03113 381 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 TMEM31Q5JXX7 168 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 Q6ZS52 159 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 PEX26Q7Z412 305 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 REXO1L1PQ8IX06 675 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 APCDD1Q8J025 514 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 DCAF4L2Q8NA75 395 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 KRT35Q92764 455 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 ALS2CR12Q96Q35 445 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 CALN1Q9BXU9 219 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 CIPCQ9C0C6 399 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 MUC3BQ9H195 1237 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 MAGEH1Q9H213 219 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 DNAI1Q9UI46 699 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 AMFRQ9UKV5 643 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 HCN2Q9UL51 889 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 PYCARDQ9ULZ3 195 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-217ENST00000593166 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.161e-16■■■□□ 16.7
SLC25A39-217ENST00000593166 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-217ENST00000593166 A0A0D9SEW6 157 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-217ENST00000593166 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-217ENST00000593166 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
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