RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-208	ENST00000587914	AVIL	O75366	819 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	CABYR	O75952	493 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	CHRNA1	P02708	482 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	LTF	P02788	710 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	RARB	P10826	455 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	VAV1	P15498	845 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	TYMP	P19971	482 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	ADRA1D	P25100	572 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	SERPINB6	P35237	376 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	MLH1	P40692	756 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	CXCR3	P49682	368 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	MAP3K7CL	P57077	242 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	GALNT2	Q10471	571 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	GRIK3	Q13003	919 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	UPP1	Q16831	310 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	INSC	Q1MX18	579 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	ICE2	Q659A1	982 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	TREML1	Q86YW5	311 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	HDAC11	Q96DB2	347 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	P2RY11	Q96G91	374 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	SERAC1	Q96JX3	654 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZFP42	Q96MM3	310 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	C7orf26	Q96N11	449 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	GAD1	Q99259	594 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	SMO	Q99835	787 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	FNIP2	Q9P278	1114 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	PLLP	Q9Y342	182 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	EVPL	Q92817	2033 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	CIT	O14578	2027 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914		I3L4J1	428 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	CLDN5	O00501	218 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	CA12	O43570	354 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	RFPL1	O75677	317 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	BEST1	O76090	585 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	AP2A1	O95782	977 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	ADH1C	P00326	375 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	ALDH1A1	P00352	501 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	FYN	P06241	537 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	POLB	P06746	335 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	DNAJB1	P25685	340 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	HADHA	P40939	763 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	TM4SF4	P48230	202 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	NPY2R	P49146	381 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	CLCNKB	P51801	687 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	NRL	P54845	237 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	TPI1	P60174	286 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	MGAT5	Q09328	741 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	WASHC5	Q12768	1159 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	TUSC3	Q13454	348 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	KRT72	Q14CN4	511 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	FAXC	Q5TGI0	409 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	LCA5	Q86VQ0	697 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	LZTR1	Q8N653	840 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRPV1	Q8NER1	839 aa		7.37	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms