RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584377.5

CSNK1D-222, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 2,891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-222	ENST00000584377	DCLK1	O15075	740 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	RARB	P10826	455 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ADRA1B	P35368	520 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	RABGGTB	P53611	331 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	MAP2K5	Q13163	448 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	RINL	Q6ZS11	566 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM72B	Q86X60	149 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	THAP1	Q9NVV9	213 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	FYN	P06241	537 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	POLB	P06746	335 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ERCC2	P18074	760 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	PDE1B	Q01064	536 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	NAB1	Q13506	487 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	MORN1	Q5T089	497 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SENP8	Q96LD8	212 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SLC9A7	Q96T83	725 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	GLRA3	O75311	464 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	FBXO21	O94952	628 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ITGA2B	P08514	1039 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	RCN1	Q15293	331 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	CES3	Q6UWW8	571 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	RASSF3	Q86WH2	238 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	GSR	P00390	522 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ERVK-10	P10266	1014 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	MLH1	P40692	756 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	DAOA	P59103	153 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	TPI1	P60174	286 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	CDK18	Q07002	472 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	OLIG2	Q13516	323 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	IRF5	Q13568	498 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	AGAP3	Q96P47	875 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	KCNK16	Q96T55	309 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	EMCN	Q9ULC0	261 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	NCAM1	P13591	858 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	PTPN3	P26045	913 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	CPA2	P48052	419 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	AIF1	P55008	147 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	CCL14	Q16627	93 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM35A	Q86V20	835 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	NTAN1	Q96AB6	310 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	CERS2	Q96G23	380 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	RILP	Q96NA2	401 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SMO	Q99835	787 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	CAPN14	A8MX76	684 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377		I6L893	689 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	PLIN3	O60664	434 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	USP17L7	P0C7H9	530 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	FKBP1B	P68106	108 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SCAP	Q12770	1279 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	LSAMP	Q13449	338 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	MBLAC2	Q68D91	279 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	PCED1B	Q96HM7	432 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-222	ENST00000584377	USP12	O75317	370 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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