RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 DOCK4Q8N1I0 1966 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 ARHGAP42A6NI28 874 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 E7EVH7 732 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 H0YGN5 161 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 KCNK1O00180 336 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 POU2F2P09086 479 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 GJA1P17302 382 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 PTPN3P26045 913 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 ARL4CP56559 192 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 WASHC5Q12768 1159 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 KCNJ11Q14654 390 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 ADGRF1Q5T601 910 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 FAXCQ5TGI0 409 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 CENPUQ71F23 418 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 SHKBP1Q8TBC3 707 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 EXOC4Q96A65 974 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 ETNK1Q9HBU6 452 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 NDFIP2Q9NV92 336 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 RHOP08100 348 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 LMAN1P49257 510 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 HIF1AQ16665 826 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 GPR158Q5T848 1215 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 PID1Q7Z2X4 250 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 ZNF567Q8N184 647 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 PWWP2AQ96N64 755 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 TRHDEQ9UKU6 1024 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 GOLGA8MH3BSY2 632 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 RAMP2O60895 175 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 TMEM63AO94886 807 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 METTL18O95568 372 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 OR1E1P30953 314 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 MAGEA6P43360 314 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 CDH4P55283 916 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 DUSP6Q16828 381 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 DENND2CQ68D51 928 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 WBP2Q969T9 261 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 MYEOVQ96EZ4 313 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 CEP41Q9BYV8 373 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 PHACTR1Q9C0D0 580 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 PLAAQ9Y263 795 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-208ENST00000566637 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 RASA4BC9J798 803 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 RASA4O43374 803 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 TPSB2P20231 275 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 CCR2P41597 374 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 NRIP1P48552 1158 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 SEMA5AQ13591 1074 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 TPSAB1Q15661 275 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 PARP6Q2NL67 630 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 ANO4Q32M45 955 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 PARP15Q460N3 678 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 LRIG3Q6UXM1 1119 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 ZNF354CQ86Y25 554 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 RELL1Q8IUW5 271 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 CFAP52Q8N1V2 620 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 ZIM3Q96PE6 472 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 SEMA4AQ9H3S1 761 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 PIDD1Q9HB75 910 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 CFAP97Q9P2B7 532 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 ZNF212Q9UDV6 495 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 SOBPA7XYQ1 873 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 MATN3O15232 486 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 MAFKO60675 156 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 CLDN11O75508 207 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 NEBLO76041 1014 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 APRTP07741 180 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 TEAD2Q15562 447 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 TEX44Q53QW1 395 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 HSP90B2PQ58FF3 399 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-208ENST00000566637 FAM182AQ5T1J6 154 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms