RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	APC2	O95996	2303 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PP55	124 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PR77	199 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	C10orf142	B7Z368	130 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688		E7ENQ6	273 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	MID1	O15344	667 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	SLC7A4	O43246	635 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	LAT	O43561	262 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ACSL4	O60488	711 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	TBL1X	O60907	577 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	SIN3B	O75182	1162 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	GNA14	O95837	355 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ADH1B	P00325	375 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	IGLV3-27	P01718	113 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	WNT1	P04628	370 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	PLA2G2A	P14555	144 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	SLC9A1	P19634	815 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	GLDC	P23378	1020 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ACP1	P24666	158 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	CD70	P32970	193 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	NXPH1	P58417	271 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	RHD	Q02161	417 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	CFHR1	Q03591	330 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	TLE3	Q04726	772 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ADIG	Q0VDE8	80 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	NNT	Q13423	1086 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	CDH18	Q13634	790 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	KRT31	Q15323	416 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	VWA3B	Q502W6	1294 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	HS1BP3	Q53T59	392 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ZNF843	Q8N446	348 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	EDEM1	Q92611	657 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	MYO19	Q96H55	970 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	LMLN	Q96KR4	655 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	TSPY26P	Q9H489	355 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	EBF2	Q9HAK2	575 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	DMTF1	Q9Y222	760 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PTPRB	P23467	1997 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	BECN2	A8MW95	431 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688		J3QKU1	62 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	BRINP1	O60477	761 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	FBXO21	O94952	628 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	VDR	P11473	427 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CSK	P41240	450 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	OXCT1	P55809	520 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TBX4	P57082	545 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	DAOA	P59103	153 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ECT2L	Q008S8	904 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SULT2A1	Q06520	285 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SLC12A1	Q13621	1099 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	STAT4	Q14765	748 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	STIL	Q15468	1287 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	MAN2A1	Q16706	1144 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	MIIP	Q5JXC2	388 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	BROX	Q5VW32	411 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		7.08	□□□□□ -1.28

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