RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547318.5

LETMD1-209, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LETMD1, Length 2,001 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-209ENST00000547318 GATA6Q92908 595 aa14.94□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.94□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.94□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 OSMRQ99650 979 aa14.94□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 TINF2Q9BSI4 451 aa14.94□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 RTKNQ9BST9 563 aa14.94□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CDH19Q9H159 772 aa14.94□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 S100A14Q9HCY8 104 aa14.94□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.94□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.94□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.94□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 DPPA5A6NC42 116 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ZNF195O14628 629 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 KIF3CO14782 793 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 AHCYL1O43865 530 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CREB3O43889 395 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 TRIM13O60858 407 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PDHA1P08559 390 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CYP2B6P20813 491 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 KCNA4P22459 653 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 SNX17Q15036 470 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 UGP2Q16851 508 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 SCML4Q8N228 414 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 DTX3LQ8TDB6 740 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 IRGQQ8WZA9 623 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 EPAS1Q99814 870 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ECSITQ9BQ95 431 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ASB3Q9Y575 518 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 HSPA4LO95757 839 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 FESP07332 822 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ERCC2P18074 760 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PSEN1P49768 467 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 GTF2A2P52657 109 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 DAOAP59103 153 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ADAM17P78536 824 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 MPP3Q13368 585 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 EPGNQ6UW88 154 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CNDP1Q96KN2 507 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CXCL16Q9H2A7 254 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 HES2Q9Y543 173 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PSAT1Q9Y617 370 aa14.93□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PDHXO00330 501 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ERVK-10P10266 1014 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PAX3P23760 479 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CRADDP78560 199 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ANO4Q32M45 955 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 RAB41Q5JT25 222 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 UBXN11Q5T124 520 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 DLK2Q6UY11 383 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 BEND5Q7L4P6 421 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 URGCPQ8TCY9 931 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 TSGA13Q96PP4 275 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 SERPINI1Q99574 410 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 MED10Q9BTT4 135 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PIGVQ9NUD9 493 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 A0A096LPK6 155 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PEX1O43933 1283 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CABYRO75952 493 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 GNAT1P11488 350 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 AKAP5P24588 427 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms