RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 CXCR3P49682 368 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 TMPRSS3P57727 454 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 SEMA5AQ13591 1074 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 HNF4GQ14541 408 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 GRM3Q14832 879 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 HLFQ16534 295 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 DUSP6Q16828 381 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 KIF19Q2TAC6 998 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 MDGA2Q7Z553 956 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 CCDC25Q86WR0 208 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 SLC22A17Q8WUG5 538 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 KCNK9Q9NPC2 374 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 RNF146Q9NTX7 359 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 OCIAD1Q9NX40 245 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 SERINC4A6NH21 518 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 IGSF3O75054 1194 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 MYL4P12829 197 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 PEPDP12955 493 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 TRAF2Q12933 501 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 TRAF3Q13114 568 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 SLC5A9Q2M3M2 681 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF449Q6P9G9 518 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 MAGEB6Q8N7X4 407 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 IGSF21Q96ID5 467 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 FAR2Q96K12 515 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 FIZ1Q96SL8 496 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 PKP4Q99569 1192 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 GXYLT2A0PJZ3 443 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 STMND1H3BQB6 276 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 DHHO43323 396 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 F7P08709 466 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 FGFR2P21802 821 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 CEP85LQ5SZL2 805 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 RFLNBQ8N5W9 214 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 PHKBQ93100 1093 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 FSCN3Q9NQT6 498 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 DONSONQ9NYP3 566 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 KIF26BQ2KJY2 2108 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 M0QYT0 321 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 KIF3BO15066 747 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 ITGA5P08648 1049 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 CHRNA5P30532 468 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 DSTYKQ6XUX3 929 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 TCEAL8Q8IYN2 117 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 LRRC57Q8N9N7 239 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 SNX27Q96L92 541 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 NUP62CLQ9H1M0 184 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 SAC3D1A6NKF1 404 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 KCNJ18B7U540 433 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 J3KTA2 159 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 KCNJ13O60928 360 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRK-220ENST00000531466 IDEP14735 1019 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 GABRB3P28472 473 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 TAS2R50P59544 299 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 NXNQ6DKJ4 435 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 TMEM71Q6P5X7 295 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 CCDC33Q8N5R6 958 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 MCRS1Q96EZ8 462 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 CKAP5Q14008 2032 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 DOCK7Q96N67 2140 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 LINC01553A4QN01 128 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 RHPN2P1A8MT19 583 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 BMPR1BO00238 502 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 NKX2-8O15522 239 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 TAF5LO75529 589 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 NDST3O95803 873 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 IGFBP2P18065 325 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 EGR1P18146 543 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 TUBA1BP68363 451 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 CSHL1Q14406 222 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 AAK1Q2M2I8 961 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 AAGABQ6PD74 315 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 TTC30AQ86WT1 665 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 FAM185AQ8N0U4 392 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 DPP10Q8N608 796 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 IL25Q9H293 177 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 POM121BA6NF01 834 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 VSTM5A8MXK1 200 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 ASAP2O43150 1006 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 LDB2O43679 373 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-220ENST00000531466 SERPINB2P05120 415 aa4.84□□□□□ -1.63
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