RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526811.4

IFITM3-202, Transcript of interferon induced transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene IFITM3, Length 543 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3-202ENST00000526811 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
IFITM3-202ENST00000526811 C14orf80Q86SX3 495 aa14.65□□□□□ -0.06
IFITM3-202ENST00000526811 STK40Q8N2I9 435 aa14.65□□□□□ -0.06
IFITM3-202ENST00000526811 TWNKQ96RR1 684 aa14.65□□□□□ -0.06
IFITM3-202ENST00000526811 DUSP16Q9BY84 665 aa14.65□□□□□ -0.06
IFITM3-202ENST00000526811 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.65□□□□□ -0.06
IFITM3-202ENST00000526811 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
IFITM3-202ENST00000526811 ACSL6Q9UKU0 697 aa14.65□□□□□ -0.06
IFITM3-202ENST00000526811 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
IFITM3-202ENST00000526811 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.65□□□□□ -0.06
IFITM3-202ENST00000526811 CLIC4Q9Y696 253 aa14.65□□□□□ -0.06
IFITM3-202ENST00000526811 CSMD1Q96PZ7 3565 aa14.65□□□□□ -0.06
IFITM3-202ENST00000526811 CPED1A4D0V7 1026 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 TGFB1I1O43294 461 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 TBL1XO60907 577 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 RTN2O75298 545 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 NEBLO76041 1014 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 KIF20AO95235 890 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 VNN1O95497 513 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 LATS1O95835 1130 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 IL1BP01584 269 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 P4HA1P13674 534 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 BIRC3Q13489 604 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 GUSBP11Q6P575 273 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 TMEM145Q8NBT3 493 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 PTPRN2Q92932 1015 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 UBE4BO95155 1302 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 ITIH6Q6UXX5 1313 aa14.64□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 SLC7A4O43246 635 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 PPP6R2O75170 966 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 CASRP41180 1078 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 CASP4P49662 377 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 CYP2J2P51589 502 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 PDX1P52945 283 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 METAP1P53582 386 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 CYP4F2P78329 520 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 MORC3Q14149 939 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 FIBINQ8TAL6 211 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 IFT43Q96FT9 208 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 USP28Q96RU2 1077 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 ADNPQ9H2P0 1102 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 C2CD3Q4AC94 2353 aa14.63□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 CELSR2Q9HCU4 2923 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 CLIC2O15247 247 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 F13A1P00488 732 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 LIPCP11150 499 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 AP3M2P53677 418 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 BECN1Q14457 450 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 NCAPHQ15003 741 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 MFN1Q8IWA4 741 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 OR13H1Q8NG92 308 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 HTR3CQ8WXA8 447 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 CALN1Q9BXU9 219 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 CUEDC2Q9H467 287 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 CFAP45Q9UL16 551 aa14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.61□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.61□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 PLD2O14939 933 aa14.61□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 CASC3O15234 703 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 SPTLC2O15270 562 aa14.61□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 WT1P19544 449 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
IFITM3-202ENST00000526811 ASPAP45381 313 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms