RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	IL31	Q6EBC2	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ELP5	Q8TE02	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	MUL1	Q969V5	352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	MED30	Q96HR3	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	RGS14	O43566	566 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	NEK3	P51956	506 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	SELENOV	P59797	346 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057		Q6ZTK2	550 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1B0GVT2	93 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	HOXC6	P09630	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	CPA1	P15085	419 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ABAT	P80404	500 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	GPS2	Q13227	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	MYD88	Q99836	296 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	WNT16	Q9UBV4	365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.84	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	SPRY3	O43610	288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	LARGE1	O95461	756 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	ARSB	P15848	533 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	CHRNA5	P30532	468 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	TNFSF8	P32971	234 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	SLC16A2	P36021	539 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	STAT1	P42224	750 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	GPR18	Q14330	331 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	NPAS1	Q99742	590 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	ICK	Q9UPZ9	632 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	CYP1A2	P05177	515 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	CHRNB2	P17787	502 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	DSCR9	P59020	149 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	PKP1	Q13835	747 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	DUSP6	Q16828	381 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	SRL	Q86TD4	932 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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