RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ARID2	Q68CP9	1835 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM150B	A6NC51	233 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CAPN14	A8MX76	684 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	EPCAM	P16422	314 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	PTPN7	P35236	360 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	NBL1	P41271	181 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC6A9	P48067	706 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	DSC1	Q08554	894 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	TFDP1	Q14186	410 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	EMC2	Q15006	297 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	LETM2	Q2VYF4	491 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	SKAP1	Q86WV1	359 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	HACE1	Q8IYU2	909 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ST8SIA2	Q92186	375 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	STAM	Q92783	540 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	HAS1	Q92839	578 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	GJA10	Q969M2	543 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CEP170P1	Q96L14	293 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ADO	Q96SZ5	270 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	IPP	Q9Y573	584 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552		B5MCH6	92 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552		B8ZZF3	427 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	MUSK	O15146	869 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	AKAP10	O43572	662 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	TSPAN1	O60635	241 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	PFKFB2	O60825	505 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ERLIN2	O94905	339 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ALDH2	P05091	517 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	UROD	P06132	367 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF20	P17024	532 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	KLRC2	P26717	231 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CA8	P35219	290 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	GLUD2	P49448	558 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	PTEN	P60484	403 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	SP140	Q13342	867 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ANKRD1	Q15327	319 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF149	Q8NC42	400 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	APOL5	Q9BWW9	433 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ARL5C	A6NH57	179 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC154	A6NI56	674 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	DDHD2	O94830	711 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	IL33	O95760	270 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	GLUD1	P00367	558 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	7.43	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	AOC1	P19801	751 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	TDG	Q13569	410 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		7.43	□□□□□ -1.22

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