RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513618.1

SPATA20-223, Transcript of spermatogenesis associated 20, human

TSL 2

Gene SPATA20, Length 629 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA20-223	ENST00000513618	ACACA	Q13085	2346 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPATA20-223	ENST00000513618	APC2	O95996	2303 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	ENC1	O14682	589 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	LAT	O43561	262 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	CALCA	P01258	141 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	IL1B	P01584	269 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	IGLV3-25	P01717	112 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	KRT5	P13647	590 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	PLK1	P53350	603 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	MTA1	Q13330	715 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TTI2	Q6NXR4	508 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TMEM110	Q86TL2	294 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	APCDD1	Q8J025	514 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	STK40	Q8N2I9	435 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	NXPE2	Q96DL1	559 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	SERAC1	Q96JX3	654 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	SPAG5	Q96R06	1193 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	THAP9	Q9H5L6	903 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	ITPR1	Q14643	2758 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TLR4	O00206	839 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	SLC7A4	O43246	635 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	MAGEC1	O60732	1142 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	RFPL3	O75679	317 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	RXRG	P48443	463 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	KCNH2	Q12809	1159 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	OVGP1	Q12889	678 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	SHB	Q15464	509 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	FAM81B	Q96LP2	452 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	18.19	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618		A0A1B0GVM2	712 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618		E5RJQ4	531 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	GLI1	P08151	1106 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	JUP	P14923	745 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	NXPH1	P58417	271 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	IQCH	Q86VS3	1027 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	NELFB	Q8WX92	580 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	DMTF1	Q9Y222	760 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	TMEM131	Q92545	1883 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	PDGFRA	P16234	1089 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	CCR1	P32246	355 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	DRD3	P35462	400 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	CDK17	Q00537	523 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	ILK	Q13418	452 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	ISM2	Q6H9L7	571 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	EID2	Q8N6I1	236 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SPATA20-223	ENST00000513618	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		18.17	■□□□□ 0.5

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