RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512107.5

MATR3-238, Transcript of matrin 3, human

TSL 4

Gene MATR3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-238	ENST00000512107	PFKP	Q01813	784 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	AFMID	Q63HM1	303 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	LRRC31	Q6UY01	552 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MFN1	Q8IWA4	741 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PLD5	Q8N7P1	536 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	FAM3C	Q92520	227 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	RNF157	Q96PX1	679 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	EPAS1	Q99814	870 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CALN1	Q9BXU9	219 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	LRRC19	Q9H756	370 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TMEM51	Q9NW97	253 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	F5	P12259	2224 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107		A0A0A0MRY4	1105 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107		H0Y626	953 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PI15	O43692	258 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MFSD11	O43934	449 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SNAP91	O60641	907 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CLDN11	O75508	207 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	KAT7	O95251	611 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CD160	O95971	181 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	GLUL	P15104	373 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	DES	P17661	470 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	GBE1	Q04446	702 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	NR1H3	Q13133	447 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	GAS6	Q14393	721 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PDK2	Q15119	407 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	HS1BP3	Q53T59	392 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PNKP	Q96T60	521 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ACOX2	Q99424	681 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	GGA2	Q9UJY4	613 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ZMPSTE24	O75844	475 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	RHOC	P08134	193 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CHRNB1	P11230	501 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	OR1E1	P30953	314 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CXCR5	P32302	372 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SEC13	P55735	322 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MTA1	Q13330	715 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	KAZN	Q674X7	775 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107		Q6ZS52	159 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TERB1	Q8NA31	727 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TRIM58	Q8NG06	486 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	EXD1	Q8NHP7	514 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	HMCES	Q96FZ2	354 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MYO19	Q96H55	970 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF670	Q9BS34	389 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MTG2	Q9H4K7	406 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	DEC1	Q9P2X7	70 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CCDC66	A2RUB6	948 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	RASA4B	C9J798	803 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	RASA4	O43374	803 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	14.92	□□□□□ -0.02	4e-7	■■■□□ 14.6
MATR3-238	ENST00000512107	MT-CO1	P00395	513 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02

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