RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 UBASH3AP57075 661 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 TPM4P67936 248 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 OGDHQ02218 1023 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 SFMBT2Q5VUG0 894 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 LYSMD4Q5XG99 296 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR59Q6PJI9 974 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM124AQ86V42 546 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 MCOLN2Q8IZK6 566 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS45Q9NRW7 570 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 DLL3Q9NYJ7 618 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF212Q9UDV6 495 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 CACNA1EQ15878 2313 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 LNP1A1A4G5 178 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP19.24■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 31.8
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 AP5Z1O43299 807 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 MOCS3O95396 460 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKCIP41743 596 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 CDH4P55283 916 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS14P62263 151 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ECT2LQ008S8 904 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ACAD10Q6JQN1 1059 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMB7Q99436 277 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 FSCN3Q9NQT6 498 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 AIPL1Q9NZN9 384 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 OR51B4Q9Y5P0 310 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD36A6QL64 1941 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM72CH0Y354 149 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 SRGAP2O75044 1071 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN11O75508 207 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC172P0C7W6 258 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFAIP3P21580 790 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 CD6P30203 668 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ST8SIA6P61647 398 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF33AQ06730 810 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 MTA1Q13330 715 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 FIGNQ5HY92 759 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM72AQ5TYM5 149 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 MANEALQ5VSG8 457 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 HGSNATQ68CP4 663 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM72DQ6L9T8 149 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC36A4Q6YBV0 504 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM72BQ86X60 149 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 FEM1AQ9BSK4 669 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR174Q9BXC1 333 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ITM2CQ9NQX7 267 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 SERGEFQ9UGK8 458 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0D9SEW6 157 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 SIGLEC16A6NMB1 481 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 DRGXA6NNA5 263 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 SNAP91O60641 907 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV3-19P01714 112 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 GYPCP04921 128 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 RHOCP08134 193 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 GLDCP23378 1020 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 PLK1P53350 603 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL30Q0D2K2 578 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 E2F5Q15329 346 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf64Q5T6V5 341 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 STRADAQ7RTN6 431 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 HAPLN3Q96S86 360 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 EDEM2Q9BV94 578 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM7Q9C029 511 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 MUC3BQ9H195 1237 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS28Q9UK41 221 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 PILRBQ9UKJ0 227 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 C7P10643 843 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ACSL1P33121 698 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ADRA1BP35368 520 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 METAP1P53582 386 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP8P85298 464 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC12A1Q13621 1099 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 NFKBIBQ15653 356 aa19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms